关于您提出的“公司用其他公司代缴社保代发部分工资是否合法”的问题，这确实是一个涉及法律合规性的重要议题。以下是我对此问题的详细分析：
合法性判断
代缴社保和代发工资的行为，其合法性并非一概而论，而是需要结合具体情况以及相关法律法规进行综合判断。在具备合法委托协议、符合劳动法规和税务规定的前提下，这样的行为是合法的。但若缺乏正规手续或存在逃避监管、税务违规等非法活动，则可能构成违法。
合法情形分析
合法委托协议：
- 如果两家公司之间签订了合法有效的委托代缴社保和代发工资协议，并明确规定了双方的权利和义务，包括代缴社保的基数、比例，代发工资的金额、方式、时间等，那么这种行为属于正常的商业合作，是合法的。
- 例如，一些集团公司为了统一财务管理，可能会选择由一家子公司代为缴纳社保和发放工资。
符合劳动法规和税务规定：
- 在代缴社保和代发工资的过程中，必须严格遵守劳动法律法规和税务规定。这包括准确核算工资数额，依法代扣代缴员工的个人所得税、社会保险费等。
- 人力资源服务公司接受企业委托代缴社保和代发工资时，也需按国家规定为员工足额缴纳社保和代扣个税。
劳务派遣与劳务外包：
- 如果存在劳务派遣或劳务外包等正规手续，那么代缴社保和代发工资也是合法的。这种情况下，代发工资不仅有助于公司节省成本，还便于管理。
可能存在的违法情形
逃避监管：
- 如果代缴社保和代发工资的行为旨在帮助委托公司逃避劳动监管，如隐瞒真实的劳动关系、规避最低工资标准、加班工资等法律规定，那么这种行为就是违法的。
- 这类行为会剥夺劳动者应有的劳动权益，如社保待遇、加班费等。
税务违规：
- 代缴社保和代发工资若涉及偷逃税款，如虚列工资支出、拆分工资以降低个税缴纳基数等，就违反了税收法律法规。
- 例如，委托公司可能以较低的工资数额代发，而实际工资通过其他方式私下发放，这种行为即构成税务违法。
洗钱等非法活动：
- 如果代缴社保和代发工资的行为被用于洗钱、转移违法所得等非法目的，那么这种行为就触犯了刑法。
- 犯罪分子可能利用代缴社保和代发工资的名义，将非法资金混入正常工资和社保流水，以掩盖资金的非法来源。
总结与建议
公司用其他公司代缴社保代发部分工资的行为，在具备合法委托协议、符合劳动法规和税务规定的前提下是合法的。但为了避免法律风险，公司在考虑这样的操作时，务必确保：
- 签订合法有效的委托协议；
- 严格遵守劳动法律法规和税务规定；
- 避免涉及任何非法活动，如逃避监管、税务违规或洗钱等。
同时，建议公司在操作前咨询专业法律意见，以确保自身合规运营，避免不必要的法律纠纷。希望这些分析能对您有所帮助。