针对“员工在职期间被拘留如何发工资”的问题，以下是根据相关法律法规和常见实践给出的详细解答：

一、工资支付原则

1. 劳动合同约定：

   • 如果员工的劳动合同中明确规定了被拘留期间工资的处理方式，单位应当按照劳动合同的约定来支付工资。

2. 无劳动合同约定：

   • 若劳动合同中没有明确约定，通常情况下，单位会按照员工正常工作时的工资标准来支付。
   • 但如果员工是因自身过错而被拘留，单位可以根据公司的规章制度酌情处理，比如暂停发放工资。

3. 被判刑罚：

   • 如果员工被判处拘役、有期徒刑等刑罚，服刑期间单位一般可以停发工资。
   • 员工被释放或刑满释放后，如果劳动合同仍然有效，单位应当恢复其工作，并按照合同约定支付工资。

二、合法性及后续处理

1. 停发工资的合法性：

   • 员工被刑事拘留期间，由于无法为单位提供劳动，单位停发工资通常是合法的。
   • 这期间，单位可以与其暂时停止劳动合同的履行，不承担劳动合同规定的相应义务。

2. 后续处理：

   • 如果员工最终被证明无罪，单位应当恢复劳动关系，并补发相应工资。
   • 如果员工被判刑，服刑期间的工资支付情况需根据劳动合同和单位规定来确定，通常单位会停发工资。

三、社保待遇处理

• 养老保险：员工被刑拘期间，单位一般会暂停缴纳养老保险费，但个人账户会予以保留且不间断计息。
• 医疗保险：企业暂停缴费期间，医保待遇通常会暂停，但个人账户余额可继续使用。
• 其他保险（工伤、失业、生育保险）：在员工被刑拘期间，企业暂停缴费后，相应待遇会受影响。若后续恢复劳动关系并缴费，符合条件时可重新享受待遇。

四、实际操作建议

1. 查阅劳动合同：首先查阅员工的劳动合同，看是否有关于被拘留期间工资支付的约定。
2. 与公司规章制度对照：如果没有劳动合同约定，参考公司的规章制度和当地法律法规来做出决定。
3. 沟通协商：与员工或员工家属进行沟通，解释公司的决定和依据。
4. 记录并备案：将处理过程和结果详细记录，并妥善保存相关文件，以备将来可能的争议或查询。

综上所述，员工在职期间被拘留的工资支付问题需要根据劳动合同、公司规章制度以及法律法规来综合判断。在处理此类问题时，单位应当遵循合法、合理、公正的原则，并确保决策过程透明、有据可依。