员工甲流死亡不算工伤。下面是对此结论的详细分析：

一. 工伤的定义与范围

1. 根据《工伤保险条例》第十四条，工伤主要包括在工作时间和工作场所内，因工作原因受到事故伤害的情况，以及患职业病的情况。
2. 甲流（甲型流感）通常被视为一种普通疾病，而非职业病，也非因工作原因直接导致的伤害。

二. 工伤认定的具体条件

1. 工伤认定需要满足一定的条件，如事故伤害必须与工作有直接因果关系。
2. 甲流作为一种疾病，其发生通常与个人的身体状况、免疫力以及是否接触到病毒等因素有关，与工作本身没有直接的因果关系。

三. 特殊情况下的工伤认定

1. 虽然某些特殊情况下，疾病也可能被认定为工伤，如职业病，但甲流并不属于职业病范畴。
2. 职业病通常是由长期接触某种特定的工作环境或物质导致的，而甲流是流感病毒引起的，与工作环境的长期接触无关。

综上所述，员工甲流死亡不符合工伤的定义和认定条件，因此不算工伤。如有进一步需要，您可以继续咨询我。