结论：在公司上班得了甲流，一般情况下不算工伤，但在特定条件下可能被认定为工伤。以下从不同角度进行分析：
一般情况：不算工伤
根据《工伤保险条例》第十四条的规定，工伤的认定通常需要满足“在工作时间和工作场所内，因工作原因受到事故伤害”或者“患职业病”等条件。甲流，即甲型流行性感冒，是一种由甲型流感病毒引起的急性呼吸道传染病，它并不属于职业病范畴。因此，在一般情况下，员工在公司上班期间感染甲流，并不符合工伤认定的基本条件，不会被认定为工伤。
特定条件：可能被认定为工伤
尽管甲流本身不属于职业病，但在某些特定条件下，员工感染甲流可能被视为与工作有关，从而有可能被认定为工伤。这些条件包括但不限于：
工作性质特殊：如果员工的工作性质特殊，例如在医疗、防疫、公共卫生等高风险岗位工作，且感染甲流与工作有直接关系（如接触甲流患者或病毒样本等），那么在这种情况下，员工感染甲流可能被视为工伤。
工作过程中发生意外：如果员工在工作过程中，因工作原因（如参加公司组织的活动、执行工作任务等）导致感染甲流，且这种感染是意外发生的，那么也有可能被认定为工伤。不过，这种情况下的认定需要具体分析，且需要充分的证据支持。
法律建议
及时就医并保留证据：如果员工在公司上班期间感染甲流，首先应及时就医并保留好相关的医疗证明和费用单据。这些证据在后续可能涉及的工伤认定和赔偿过程中将起到重要作用。
了解公司政策：员工应了解公司关于工伤认定的相关政策，以及公司是否为员工购买了工伤保险。如果公司有相关政策且员工符合工伤认定条件，那么员工可以向公司提出工伤认定申请。
咨询专业律师：如果员工对工伤认定有疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。我可以根据员工的具体情况，提供专业的法律意见和帮助。
总结：在公司上班得了甲流，一般情况下不算工伤，但在特定条件下可能被认定为工伤。员工应了解相关法律法规和公司政策，及时就医并保留证据，如有需要可以向我咨询以获取专业的法律帮助。