不需要支付双倍工资。针对“厨师长承包厨房但工资是公司发放”这一情境，我们可以从以下几个方面进行分析：
一. 承包关系与劳动关系的区别
承包关系：承包经营是企业的一种经营方式，在承包关系中，承包方和发包方是平等的民事主体。承包经营期间，承包人虽对外以发包企业的名义经营，但承包人雇佣的职工由其直接管理，工资报酬由其承担并负责发放。在整个劳动过程中，劳动者与发包方并无人身隶属关系，即劳动者与发包方（如公司）不存在劳动关系。
劳动关系：根据《劳动合同法》的相关规定，用人单位与劳动者建立劳动关系应当签订书面劳动合同。未签订劳动合同的，若满足特定条件（如用人单位自用工之日起超过一个月不满一年未与劳动者订立书面劳动合同的），用人单位需向劳动者支付双倍工资。但这一规定的前提是双方存在劳动关系。
二. 工资发放主体的影响
工资发放主体：虽然工资是由公司发放，但这一行为并不足以证明公司与厨师之间存在劳动关系。关键在于看公司发放工资是基于何种法律关系。在承包关系中，承包人可能因资金流转、税务处理等原因，委托发包方（公司）代为发放工资，但这并不改变承包人与劳动者之间的雇佣关系。
劳动关系判断标准：判断劳动者与用人单位之间是否存在劳动关系，应重点看以下几点：用人单位是否具有用工资格；劳动者是否受用人单位管理；劳动者是否由用人单位发放工资；劳动者从事的工作是否属于用人单位业务。这些要素需要综合考量，不能仅凭工资发放主体来判断。
三. 结论与建议
结论：在厨师长承包厨房的情境下，即使工资由公司发放，也不需要支付双倍工资，因为公司与厨师之间可能并不存在劳动关系，而是承包关系。
建议：为了避免类似的法律纠纷，建议公司在与承包人签订承包协议时，明确双方的权利义务关系，特别是关于员工管理、工资发放等方面的约定。同时，承包人也应加强对员工的管理和权益保障，确保员工的合法权益不受侵害。
我的观点是，在处理此类问题时，应首先明确双方的法律关系性质，再依据相关法律法规进行具体分析。如有进一步需要，您可以继续咨询我。