员工5月6日离职，其工资应根据实际出勤天数进行计算。具体来说，计算方式如下：
一. 计算基本工资的日工资
二. 计算实际出勤天数
三. 计算应得工资
举例说明：
一. 特殊情况处理
加班工资：如果员工在离职前有加班，加班工资应单独计算并计入应得工资。具体计算方式如下：
请假扣款：如果员工在离职前有请假，应按照公司规定计算请假扣款，并从应得工资中扣除。
二. 其他注意事项
不得克扣或拖欠：根据《中华人民共和国劳动法》第五十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠。因此，即使员工离职，用人单位也应按照法律规定及时足额支付其应得的劳动报酬。
经济补偿：如果员工是因用人单位的原因（如裁员、解散等）而离职，且员工无过错，除正常工资结算外，还可能涉及经济补偿金。经济补偿金的计算标准按照《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定执行。
总结：员工5月6日离职的工资计算主要依据其实际出勤天数和基本工资来确定。同时，需注意加班工资的计算以及请假扣款的处理。用人单位应依法及时足额支付员工应得的劳动报酬，不得克扣或拖欠。如有进一步需要，您可以继续咨询我。