针对您提出的“约定可以由甲方所在地法院管辖是否必须适用”的问题，以下是对此问题的详细解答：
一、约定甲方所在地法院管辖的法律效力
在合同或其他民事法律关系中，约定由甲方所在地人民法院管辖是有效的，但这一约定必须满足以下条件：
不违反级别管辖和专属管辖：该约定不得违反《中华人民共和国民事诉讼法》中关于级别管辖（即根据案件性质、大小确定由哪一级法院管辖）和专属管辖（即某些特定类型的案件只能由特定法院管辖）的规定。
双方真实意思表示：该约定必须是合同双方真实、自愿的意思表示，不能存在欺诈、胁迫等情形。
二、约定甲方所在地法院管辖的具体应用
明确甲方所在地：在签订合同时，应明确界定“甲方所在地”的具体含义和范围，以避免后续争议。对于法人或其他组织，通常指注册地或主要办事机构所在地。
书面形式要求：管辖协议必须采用书面形式，包括合同中的条款或单独的管辖协议等。口头约定不具有法律效力。
提起诉讼：若合同双方发生纠纷，可按照管辖约定向甲方所在地人民法院提起诉讼。若当事人已分别向所在地人民法院提起诉讼，则应根据最高人民法院的司法解释处理，确定管辖法院。
三、特殊情况下的处理
专属管辖案件：对于某些特定类型的案件，如不动产纠纷、港口作业纠纷等，即使双方有约定，也可能因违反专属管辖的规定而无效。
级别管辖不符：如果约定的法院不符合法律关于级别管辖的规定，该约定同样可能无效。
四、实际案例
根据最高人民法院的相关案例（如(2023)最高法民辖15号案例），合同约定“该争议将提交甲方所在地有管辖权的法院诉讼解决”是有效的，前提是该约定不违反级别管辖和专属管辖的规定，并且是双方真实意思的表示。
五、总结与建议
综上所述，约定由甲方所在地法院管辖在符合法律规定和双方真实意思表示的前提下是有效的，并且必须适用。但双方在签订合同时应充分理解并同意该管辖约定，以确保其在争议解决时的有效性和可执行性。同时，也应注意避免违反级别管辖和专属管辖的规定，以免引发不必要的争端和纠纷。