结论前置：劳动合同中约定不定时工时制，并不能直接导致赔付自入职起双倍薪资的后果。不定时工时制是合法的一种工时制度，其适用需符合法定条件，且与薪资赔付无直接关联。

详细分析：

1. 不定时工时制的合法性：

   • 不定时工时制是《劳动法》及《劳动合同法》中明确规定的一种工时制度，适用于因工作性质特殊，需机动作业或无法按标准工作时间衡量的职工。
   • 企业实行不定时工作制，需报经劳动行政部门批准，并确保职工的工作、休息权益得到保障。

2. 不定时工时制与薪资赔付的关系：

   • 不定时工时制本身并不涉及薪资赔付的问题。薪资的支付应依据劳动合同的约定，以及国家关于工资支付的相关规定。
   • 除非劳动合同中有特别约定，或者企业存在违法情形（如未依法支付加班费、未保障职工休息权益等），否则不能仅因实行不定时工时制就要求企业赔付双倍薪资。

3. 可能涉及的法律后果：

   • 如果企业未依法实行不定时工时制（如未报经劳动行政部门批准），则可能面临行政处罚，但这与双倍薪资赔付无直接关联。
   • 如果企业存在未依法支付工资或加班费等违法行为，职工有权要求企业支付相应的经济补偿，但这需要根据具体情况进行法律评估。

4. 建议：

   • 如果你对劳动合同中的工时制度或薪资支付有疑问，建议仔细查阅劳动合同的约定，并了解相关法律法规的规定。
   • 如果认为企业存在违法行为，可以依法向劳动行政部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。

综上所述，劳动合同中约定不定时工时制，并不能直接导致赔付自入职起双倍薪资的后果。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。