员工离职时，工资应当一次性结清，但也可以按照劳动合同中的特殊约定执行。
法律规定：
- 根据《工资支付暂行规定》第九条，劳动关系双方依法解除或终止劳动合同时，用人单位应在解除或终止劳动合同时一次付清劳动者工资。这是为了保障劳动者及时获得劳动报酬，维护其合法权益。
特殊情况：
- 若劳动合同中有关于离职后工资支付的特殊约定，且该约定不违反法律法规强制性规定，应从其约定。例如，如果劳动合同中明确约定离职后工资按月发放，并且这一约定是双方真实意思表示，且能保证劳动者权益不受侵害，那么这一约定也是有效的。
实际操作：
- 在实践中，多数用人单位会在员工离职时结清工资，以便双方明确财务关系，避免后续纠纷。然而，也有一些用人单位可能会按照劳动合同中的约定或公司规章制度，在离职后的某个时间点（如次月发工资日）支付离职员工的工资。
劳动者权益保护：
- 若用人单位未按规定或约定支付工资，劳动者有权通过协商、向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁等途径，要求用人单位支付工资并可能承担相应赔偿责任。
综上所述，员工离职时工资的支付方式需依法律规定及劳动合同约定来确定。在一般情况下，用人单位应一次性结清工资；但若劳动合同中有特殊约定，且该约定合法有效，则可从其约定。无论何种情况，用人单位都应依法依约支付离职员工的工资，保障劳动者的合法权益。如果您在这方面有任何疑问或需要帮助，请直接向我咨询。