初中占用周末时间补课不合法。

根据教育部《关于当前加强中小学管理规范办学行为的指导意见》等相关规定，学校不得占用学生节假日、双休日组织集体补课。这一规定旨在保障学生的休息权益，减轻学生的学习负担，促进学生的身心健康和全面发展。

具体来说，初中作为义务教育阶段的学校，应当严格遵守国家关于学生休息时间的规定，不得擅自占用学生的周末时间进行补课。如果学校违反了这一规定，学生及其家长可以向当地教育行政部门进行投诉，要求学校立即停止违规行为，并依法依规处理。

因此，从法律角度来看，初中占用周末时间补课是不合法的。学校应当尊重学生的休息时间，合理安排教学活动，确保学生的身心健康和全面发展。如果学生或家长遇到此类问题，可以及时向相关部门反映并寻求帮助。