结论：下游企业被稽查局罚款后是否可以起诉，需分情况讨论，主要取决于罚款的合法性及下游企业是否存在过错。以下从不同角度展开分析：

1. 若稽查局罚款合法，下游企业一般无权起诉
   根据《税收征收管理法》及《行政处罚法》，稽查局对虚开发票的下游企业罚款需满足两个条件：

   • 程序合法：稽查局需依法立案、调查取证、告知权利、听取陈述申辩或举行听证，最终作出处罚决定；
     
   • 实体合法：下游企业需存在“知道或应当知道”上游虚开发票的情形（如交易价格明显偏低、未履行基本审核义务等）。
     若稽查局处罚程序与实体均合法，下游企业仅能通过行政复议或行政诉讼主张程序瑕疵（如未告知权利），但难以推翻罚款本身。此时起诉意义有限，建议优先申请行政复议（60日内提出）。

2. 若稽查局罚款违法，下游企业可起诉
   若稽查局存在以下情形，下游企业可向法院提起行政诉讼，要求撤销或变更处罚：

   • 事实认定错误：如下游企业已尽到合理审核义务（如要求上游提供发票、合同、资金流三流一致证明），但稽查局仍认定其“应当知道”虚开；
     
   • 程序严重违法：如未依法送达处罚决定书、未告知复议或诉讼权利；
     
   • 处罚幅度不当：如罚款金额明显超出法定标准（如按虚开金额的50%罚款，但实际应按30%处罚）。
     关键点：需在收到处罚决定书之日起6个月内起诉，并准备交易合同、付款记录、审核证据等材料证明自身无过错。

3. 下游企业可同步追究上游责任以弥补损失
   无论是否起诉稽查局，下游企业均可通过民事诉讼向上游企业追偿：

   • 合同纠纷：若双方合同明确约定“发票合法性由上游负责”，下游可要求上游赔偿罚款、滞纳金等损失；
     
   • 侵权责任：若上游虚开发票导致下游信用受损（如被列为纳税异常户），可主张精神损害赔偿（需结合具体损失证明）；
     
   • 刑事报案：若上游虚开金额巨大（如税款数额在10万元以上），可向公安机关报案，追究其刑事责任（虚开增值税专用发票罪最高可处无期徒刑）。

行动建议：

1. 立即整理交易全流程证据（合同、付款凭证、物流单据、沟通记录等），证明自身已尽审核义务；
   
2. 在60日内向稽查局上级税务局申请行政复议，或6个月内直接向法院起诉（若复议结果不利）；
   
3. 同步委托律师对上游企业发起民事诉讼，要求赔偿全部损失。
   

提示：虚开发票案件中，下游企业是否“明知”是核心争议点，需重点准备证据反驳稽查局的推定。如有进一步材料或疑问，可随时向我咨询具体应对方案。