结论：老板不能直接将钱转给劳动部门工作人员让其代付农民工工资，这种做法存在法律风险且不符合常规操作流程。
分析说明：
法律程序与规定：
- 根据相关法律法规，工资支付应当遵循严格的程序和规定。通常情况下，工资应由用人单位直接支付给劳动者，或者通过银行转账等合法方式支付。
- 劳动部门（如劳动监察大队或劳动争议仲裁委员会）在处理工资纠纷时，主要是进行调解、仲裁或监督执行，而不是直接代为支付工资。
潜在法律风险：
- 如果老板将钱转给劳动部门工作人员个人，而非通过正规渠道支付工资，这可能构成对劳动法律法规的违反，甚至可能涉及贪污、挪用公款等违法行为。
- 对于农民工而言，如果工资不是通过正规渠道支付，他们的权益可能得不到有效保障，一旦出现纠纷，将难以维权。
正规操作流程：
- 老板应当按照劳动合同或相关协议约定的时间和方式支付农民工工资。
- 如果存在工资纠纷，老板应与农民工协商解决，或者通过劳动部门进行调解、仲裁。
- 在必要时，老板可以配合劳动部门的监督执行，确保工资按时足额支付。
建议与行动：
- 老板方面：应严格遵守劳动法律法规，按照正规流程支付农民工工资。如果存在困难或纠纷，应及时与农民工沟通，并寻求劳动部门的帮助和支持。
- 农民工方面：如果发现老板未按时足额支付工资，应及时向劳动部门投诉或举报，维护自己的合法权益。
- 双方共同：在处理工资纠纷时，应保持冷静和理性，通过合法途径解决问题，避免采取过激行为或违法手段。
后续思考依据：
- 在处理类似劳动纠纷时，了解并遵守相关法律法规是至关重要的。只有依法行事，才能确保双方的权益得到有效保障。
- 如果对工资支付流程或相关法律法规存在疑问，建议及时咨询专业律师或劳动部门工作人员，以获取准确和权威的解答。
如有任何进一步的问题或需要法律帮助，请直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。