结论：劳动合同中约定离职需提前90天，这一条款的效力及应对方式需分情况讨论，具体如下：

1. 条款效力分析
   根据《劳动合同法》第三十七条，劳动者提前30日以书面形式通知用人单位，即可解除劳动合同（试用期为3日）。法律对离职通知期有强制性规定，用人单位与劳动者约定的“提前90天离职”条款，因违反法律强制性规定而无效。即使劳动合同中有此约定，劳动者仍只需按法定30日通知期离职，无需承担违约责任。

2. 特殊情形下的例外
   若劳动者属于以下两类人员，可能需遵守更长的通知期：

   • 掌握商业秘密或核心技术的人员：根据《劳动合同法》第二十四条，对负有保密义务的劳动者，用人单位可在劳动合同或保密协议中约定竞业限制条款，并约定在解除或终止劳动合同后的竞业限制期限内（最长不超过2年），按月给予经济补偿。但竞业限制条款仅限制劳动者离职后的就业范围，不延长法定离职通知期。
     
   • 服务期约定人员：若用人单位为劳动者提供专项培训费用并约定服务期，劳动者违反服务期约定的，需按约定支付违约金（《劳动合同法》第二十二条）。但服务期违约责任与离职通知期无关，劳动者仍可按法定30日通知期离职，仅需承担违约金责任。

3. 劳动者应对建议

   • 书面通知离职：按法定30日通知期（试用期3日）向用人单位提交书面离职申请，保留送达证据（如邮寄回执、签字确认等）。
     
   • 拒绝不合理要求：若用人单位以“合同约定90天”为由阻挠离职，可明确告知其条款无效，并保留沟通记录作为证据。
     
   • 协商解决：若因工作交接需要延长离职时间，可与用人单位协商一致后书面确认，但协商结果不得低于法定标准（如用人单位要求延长至45日，需劳动者同意）。
     
   • 投诉或仲裁：若用人单位扣发工资、拒绝办理离职手续或要求支付违约金（无服务期约定时），可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。

总结：劳动合同中“提前90天离职”的约定因违法而无效，劳动者无需遵守。若遇用人单位阻挠，可依法主张权利，必要时通过法律途径解决。如有具体争议，可进一步向我说明情况，我会结合细节为您分析。