针对您提出的“员工2026年6月30日离职，还有三天年假未休如何处理”的问题，以下是我根据相关法律法规为您提供的详细解答：

首先，我们需要明确的是，根据《职工带薪年休假条例》以及《企业职工带薪年休假实施办法》的相关规定，职工在离职时，如果当年度未安排职工休满应休年休假天数的，用人单位应当按照职工当年已工作时间折算应休未休年休假天数，并支付未休年休假工资报酬。

具体到您的情况，员工在2026年6月30日离职，且还有三天年假未休。那么，我们需要计算员工在离职前已经在本单位工作了多少天，以此来折算应休未休的年休假天数。不过，由于您已经明确指出还有三天年假未休，我们可以直接基于这个信息来进行后续处理。

接下来，我们有两种处理方式：

1. 安排休假：

   • 如果条件允许，用人单位可以在员工离职前安排其休完这三天年假。这样，员工就能享受到完整的年休假权益，用人单位也无需支付额外的未休年休假工资报酬。

2. 支付工资报酬：

   • 如果由于工作原因无法安排员工在离职前休完年假，用人单位则需要按照员工日工资收入的300%支付这三天未休年休假的工资报酬。这里需要注意的是，日工资收入的计算应当基于员工在离职前12个月的平均工资，或者如果员工在本单位工作不满12个月，则按照实际工作月份的平均工资来计算。

另外，我还想提醒您的是，根据相关规定，折算后不足1整天的部分是不支付未休年休假工资报酬的。但在您的情况下，员工还有完整的三天年假未休，所以不存在这个问题。

综上所述，对于员工在离职时还有三天年假未休的情况，用人单位可以选择安排员工在离职前休完年假，或者按照员工日工资收入的300%支付未休年休假的工资报酬。希望这个解答能够帮助您更好地处理这个问题。如果您还有其他疑问或需要进一步的帮助，请随时告诉我。