如果公司已经不存在了，确实会给劳动仲裁带来一定的困难，但并非完全无法进行，以下是一些具体的分析和建议：
确认公司状态：
- 首先，需要确认公司是否真的已经注销或解散。可以通过工商行政管理部门查询公司的注册信息，了解公司的当前状态。如果公司确实已经注销，那么劳动仲裁的对象可能已经不存在，但并不意味着你的权益就无法得到保障。
寻找责任主体：
- 如果公司已经注销，但存在未清算的财产或者清算后仍有剩余财产，你可以尝试寻找公司的股东、出资人或者清算义务人作为责任主体。根据《公司法》及相关司法解释，这些主体在公司注销后，如果存在未了结的债务，可能需要承担相应的责任。
- 如果公司是因为合并、分立等原因而“不存在”的，那么根据《劳动合同法》的规定，合并或分立后的用人单位应当承担原用人单位的劳动合同权利和义务。因此，你可以向合并或分立后的用人单位主张你的权益。
申请劳动仲裁的替代方案：
- 直接起诉：如果无法找到合适的责任主体进行劳动仲裁，你可以考虑直接向人民法院提起诉讼。在诉讼中，你需要提供充分的证据证明你与公司之间存在劳动关系，以及公司未支付你应得的劳动报酬或未履行其他法定义务。
- 申请支付令：如果你只是要求公司支付拖欠的工资等劳动报酬，且符合《民事诉讼法》中关于支付令的规定，你可以向有管辖权的人民法院申请支付令。支付令是一种简便、快捷的督促程序，如果公司在规定期限内不提出异议又不履行支付令的，你可以向人民法院申请强制执行。
收集证据：
- 在进行劳动仲裁或诉讼之前，你需要收集充分的证据来证明你的主张。这些证据可能包括劳动合同、工资单、工作证、考勤记录、同事证言等。证据的充分性和真实性对于你的权益保障至关重要。
寻求法律援助：
- 如果你在处理劳动纠纷过程中遇到困难或不确定如何操作，可以寻求专业的法律援助。作为专业律师，我可以为你提供详细的法律咨询和代理服务，帮助你更好地维护自己的合法权益。
行动建议：
- 首先，通过工商行政管理部门查询公司的注册信息，确认公司的当前状态。
- 其次，尝试寻找责任主体，如公司的股东、出资人、清算义务人或合并、分立后的用人单位。
- 如果无法找到合适的责任主体进行劳动仲裁，考虑直接向人民法院提起诉讼或申请支付令。
- 在整个过程中，注意收集并保存好相关证据。
- 如有需要，及时寻求专业的法律援助。
希望这些分析和建议能对你有所帮助。如果你有任何进一步的疑问或需要更具体的法律指导，请随时向我咨询。