结论：员工工作6年以上，企业劳动合同还是每年一签，在一般情况下是合法的，但需注意特定条件下的无固定期限劳动合同签订要求。
详细分析：
通常情况下合法性：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》的规定，用人单位与劳动者可以协商一致，订立固定期限劳动合同。固定期限劳动合同是指双方约定了明确终止时间的合同。因此，只要劳资双方在平等、自愿的基础上，每年签订一次劳动合同，并连续签了6年，这种做法并不违反法律的强制性规定，是合法有效的。
满足特定条件下的无固定期限劳动合同：
- 关键在于，当连续订立二次固定期限劳动合同后，且劳动者没有《劳动合同法》第三十九条（如严重违反用人单位规章制度等）和第四十条第一项、第二项（如不能胜任工作等）规定的情形时，续订劳动合同的，除劳动者主动提出订立固定期限劳动合同外，用人单位应当与劳动者订立无固定期限劳动合同。
- 这意味着，如果在这6年期间已经连续签订了两次固定期限劳动合同，那么在第三次续签时，除非劳动者明确表示希望继续签订固定期限合同，否则用人单位有责任与劳动者签订无固定期限劳动合同。若用人单位违反此规定，拒绝与劳动者订立无固定期限劳动合同，则需自应当订立之日起向劳动者每月支付二倍的工资作为赔偿。
实际操作中的建议：
- 确保协商一致：每次签订劳动合同前，用人单位应与劳动者进行充分沟通，确保双方对合同期限、工作内容、劳动报酬等条款达成一致意见，避免后续纠纷。
- 关注无固定期限劳动合同的签订条件：用人单位应密切关注劳动者的工作年限和合同签订次数，及时评估是否需要签订无固定期限劳动合同，以避免可能的法律风险和经济赔偿。
- 保留相关证据：为避免未来可能出现的劳动争议，用人单位应妥善保管好每次签订的劳动合同及相关协商记录，以备不时之需。
举例说明：
假设某员工在一家企业连续工作了6年，且每年都签订了一次固定期限劳动合同。在这6年期间，如果前两次都是固定期限劳动合同，且员工没有违反公司规章制度或不能胜任工作等情形，那么在第三次续签时，除非员工主动提出继续签订固定期限劳动合同，否则企业应当与员工签订无固定期限劳动合同。如果企业拒绝签订，员工有权要求企业支付双倍工资作为赔偿。
总结与建议：
劳动合同每年一签，连续签6年在大多数情况下是合法的，但用人单位需特别注意已连续订立二次固定期限劳动合同后的法律规定。为确保合规性并降低法律风险，建议用人单位在签订劳动合同时，充分与劳动者沟通并协商一致，同时密切关注劳动者的合同签订次数和工作年限，及时评估并签订无固定期限劳动合同（如符合条件）。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。