结论：单位以员工脑梗后不胜任本职工作为由降薪，这一行为是否合法需分情况讨论，若单位有充分证据证明员工确实不胜任工作，且降薪程序合法，则可能合法；反之，则不合法。
一、合法性分析
不胜任工作的认定：
- 根据《劳动合同法》及相关规定，员工不胜任工作是指员工不能按照劳动合同约定的岗位要求完成工作任务，或者经过培训或调整工作岗位后，仍不能胜任工作。
- 在您的情况下，单位需提供充分证据证明您因脑梗导致无法胜任原工作，如医疗证明、工作表现评估等。
降薪的合法性条件：
- 协商一致：根据《劳动合同法》第三十五条，用人单位与劳动者协商一致，可以变更劳动合同约定的内容，包括工资。因此，如果单位与您就降薪事宜达成一致，并签订书面协议，则降薪行为合法。
- 法定程序：若单位单方面决定降薪，则需满足法定程序。通常，这包括证明员工不胜任工作、进行培训或调整工作岗位、再次证明不胜任工作，并提前通知员工降薪决定。若单位未遵循这些程序，降薪行为可能违法。
特殊情况下的保护：
- 根据《劳动合同法》第四十二条，劳动者患病或者非因工负伤，在规定的医疗期内的，用人单位不得依照本法第四十条、第四十一条的规定解除劳动合同。虽然此条款未直接涉及降薪，但体现了对患病员工的特殊保护。若您仍处于医疗期内，单位单方面降薪可能面临法律风险。
二、建议与行动
与单位沟通：
- 首先，建议您与单位进行沟通，了解降薪的具体原因和依据。要求单位提供您不胜任工作的证据，以及降薪的合法程序说明。
收集证据：
- 同时，您也应收集相关证据，如医疗证明、工作表现记录等，以证明您的工作能力或反驳单位的不胜任工作认定。
寻求法律援助：
- 如果与单位沟通无果，或您认为单位的降薪行为违法，您可以向当地劳动监察部门投诉，或申请劳动仲裁。在此过程中，您可以咨询专业律师（即我本人，杨琳律师，专注于婚姻家庭、劳动纠纷领域），以获取更具体的法律建议和帮助。
注意医疗期：
- 如果您仍处于医疗期内，应特别注意保护自己的合法权益。根据法律规定，医疗期内的员工享有特殊的保护，单位不得随意解除劳动合同或降薪。
三、可能后果
若单位行为合法：
- 如果单位能够证明您不胜任工作，并遵循了法定程序进行降薪，那么降薪行为可能是合法的。您可能需要接受降薪决定，或与单位协商其他解决方案。
若单位行为违法：
- 如果单位无法证明您不胜任工作，或未遵循法定程序进行降薪，那么降薪行为可能是违法的。您有权要求单位恢复原工资水平，并可能获得相应的经济补偿。
总之，单位以员工脑梗后不胜任本职工作为由降薪是否合法，需根据具体情况和法律规定进行判断。如果您对此有疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。