在仅有合同和结算单但对方未付款的情况下，您公司开具增值税发票本身并不违法，但需要谨慎操作并注意潜在风险。以下从不同角度为您详细分析：

1. 从发票开具的合法性角度
   根据《增值税暂行条例》及《发票管理办法》，销售方在发生应税销售行为后，有义务向购买方开具增值税发票，且发票开具时间通常以实际交易发生为准，而非以付款时间为准。因此，只要您公司已实际履行合同义务（如交付货物或提供服务），即使对方尚未付款，您仍有权开具发票，且此行为本身不违法。

2. 从税务合规性角度
   开具发票后，您公司需按发票金额确认收入并缴纳增值税，即使对方未付款。若后续对方长期不付款，您公司可能面临“账上收入已确认但资金未回笼”的税务风险。建议：

   • 在发票备注栏注明“未收款”或类似字样（虽无法律强制要求，但可作为内部管理痕迹）；
     
   • 保留合同、结算单、送货单等证据，证明交易真实性，以应对税务稽查。

3. 从合同履行与风险控制角度

   • 合同条款审查：检查合同中是否约定“付款后开具发票”或“开票与付款同步”等条款。若有，您公司单方提前开票可能构成违约，需承担对方以此为由拒付货款的风险；
     
   • 风险防范建议：若对方信用不佳，可暂缓开票，或要求对方提供付款担保（如保函、抵押等）；若已开票，建议通过书面函件催款，并保留送达证据（如EMS回执、微信记录等）。

4. 从法律救济角度
   若对方最终拒付货款，您公司可凭合同、结算单、发票等证据向法院起诉，要求对方支付货款及逾期利息。发票在此过程中可作为交易发生的直接证据，但需注意：

   • 若合同明确约定“开票即视为付款”，您公司可能面临举证困难；
     
   • 若对方主张“已付款但未收回发票”，您公司需提供反证（如银行流水、对方确认未付款的书面材料等）。

总结建议：

• 若合同无特殊约定且对方信用可靠，可正常开票，但需同步加强催款；
  
• 若合同有约定或对方信用存疑，建议暂缓开票，或通过补充协议明确开票与付款的先后顺序；
  
• 无论是否开票，均需妥善保存交易证据，以备后续维权。
  

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