上班迟到扣一百元是否合法，主要取决于用人单位的规章制度是否合法制定、扣罚金额是否合理，以及是否存在特殊情况。以下从这几个方面为你详细分析：
一、规章制度的合法性
制定程序合法：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第四条，用人单位在制定、修改或者决定有关劳动报酬、工作时间等直接涉及劳动者切身利益的规章制度时，应当经职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或者职工代表平等协商确定。同时，应将该规章制度公示或告知劳动者。
- 如果用人单位关于迟到扣钱的规章制度经过了上述合法程序制定，并且已经公示或告知了劳动者，那么该规章制度在程序上是合法的。
内容合法：
- 规章制度的内容不得违反法律法规的强制性规定。例如，不能规定迟到一次就扣除全部工资等明显不合理的条款。
二、扣罚金额的合理性
不得超过法定比例：
- 扣除的工资部分通常不能超过劳动者当月工资的20%（具体比例可能因地区和具体规定而异，但一般以此为参考），且扣除后的剩余工资不得低于当地最低工资标准。
- 如果迟到一次扣除一百元后，劳动者的工资仍然高于当地最低工资标准，且扣除比例在合理范围内，那么这种扣罚可能是合法的。
与实际损失相关：
- 用人单位若能证明员工迟到给公司造成了经济损失（如影响生产进度、订单交付延迟等），且扣除的金额在合理弥补损失范围内，那么扣罚也具有一定的合理性。但这种情况需要用人单位提供充分的证据来支持。
三、特殊情况的处理
- 如果员工迟到是因不可抗力等合理原因导致的（如自然灾害、突发疾病、交通意外等），用人单位应合理考虑并不予扣钱。在这种情况下，如果用人单位仍然进行扣罚，则可能不合理且不合法。
四、维权途径
- 如果劳动者认为用人单位的扣罚行为不合法，首先可以与用人单位进行沟通协商，要求其说明扣罚依据并改正。
- 协商不成时，劳动者可以向当地劳动监察部门投诉，或申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。在投诉或申请仲裁时，劳动者需要提供相关的证据来支持自己的主张，如工资条、规章制度、迟到记录等。
举例说明
假设某公司规定迟到一次扣除一百元，且该规定已经经过了职工代表大会讨论并公示。某员工月工资为5000元，当地最低工资标准为2000元。如果该员工迟到一次被扣除一百元后，其剩余工资为4900元，仍然高于当地最低工资标准，且扣除比例在合理范围内（未超过当月工资的20%），那么这种扣罚可能是合法的。但如果该员工月工资仅为2500元，扣除一百元后剩余工资为2400元，虽然仍然高于最低工资标准，但扣除比例相对较高（达到了当月工资的4%），且如果公司无法证明该员工迟到给公司造成了相应的经济损失，那么这种扣罚可能就不太合理。
总结来说，上班迟到扣一百元是否合法需要综合考虑多个因素。作为劳动者，在面对扣罚时应当了解自己的权益和用人单位的规章制度；作为用人单位，在制定规章制度时应当确保合法性和合理性，以构建和谐稳定的劳动关系。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。