结论前置：上班迟到一分钟扣100元，这一做法是否合法，需结合具体情况来判断，但一般情况下，这种扣款方式可能涉嫌违法。以下从多个角度进行分析：

1. 从劳动合同和规章制度的角度：

   • 根据《劳动合同法》及相关规定，用人单位与劳动者签订的劳动合同以及用人单位制定的规章制度，应当遵循合法、公平、平等自愿、协商一致、诚实信用的原则。
   • 如果劳动合同或规章制度中明确规定了迟到扣款的条款，且该条款不违反法律法规的强制性规定，那么用人单位可以依据该条款进行扣款。但扣款金额应当合理，不能过分高于劳动者因迟到给用人单位造成的实际损失。
   • 在本例中，迟到一分钟扣100元，这一扣款金额可能显得过高，与劳动者因迟到可能给用人单位造成的实际损失不成比例，因此可能涉嫌违法。

2. 从工资支付的角度：

   • 根据《工资支付暂行规定》及相关规定，用人单位不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。
   • 如果用人单位以迟到为由扣款，且扣款金额不合理，那么这种行为可能构成克扣工资，是违法的。
   • 劳动者有权要求用人单位按照劳动合同或规章制度的规定支付工资，如果用人单位拒绝支付或克扣工资，劳动者可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。

3. 从实际损失的角度：

   • 劳动者迟到确实可能给用人单位造成一定的损失，如影响工作效率、导致客户不满等。但这种损失应当是实际发生的、可计算的。
   • 如果用人单位无法证明劳动者迟到一分钟给其造成了100元的实际损失，那么扣款100元就缺乏合理性依据。

法律建议：

• 对于劳动者而言，如果遇到用人单位以迟到为由不合理扣款的情况，可以先与用人单位协商解决；协商不成的，可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
• 对于用人单位而言，应当制定合理的规章制度和劳动合同条款，明确迟到扣款的规则和标准，并确保这些规则和标准不违反法律法规的强制性规定。同时，用人单位在扣款时应当提供充分的证据证明劳动者迟到给其造成了实际损失，且扣款金额应当合理。

可能法律后果：

• 如果用人单位以迟到为由不合理扣款，且劳动者投诉或申请劳动仲裁成功，用人单位可能需要支付被克扣的工资、赔偿金等费用，并可能面临劳动监察部门的处罚。

综上所述，上班迟到一分钟扣100元这一做法是否合法需结合具体情况判断，但一般情况下可能涉嫌违法。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。