关于您提出的“上班迟到公司罚款100元是否合法”的问题，这并非一个简单的“是”或“否”的答案，而是需要综合考虑多个因素。以下是我为您详细分析的内容：
一、合法性分析
规章制度制定程序：
- 根据《劳动合同法》的规定，公司在制定涉及员工切身利益的规章制度时，必须经过职工代表大会或全体职工的讨论，并与工会或职工代表平等协商确定。此外，这些规章制度还需要向员工进行公示或告知。
- 如果公司关于迟到罚款的规定经过了上述合法程序，并且在制定过程中充分考虑了员工的意见，那么在程序上，这一规定是符合法律要求的。
不违反法律强制性规定：
- 我国法律法规并未明确规定迟到罚款的具体标准。但是，罚款行为不能违反法律的强制性规定，特别是不能侵犯员工的基本权益。
- 罚款后，员工的工资不得低于当地的最低工资标准。如果因为一次迟到罚款100元导致员工当月的工资低于这一标准，那么这种罚款行为就是违法的。
二、合理性分析
与实际损失相关：
- 公司需要能够证明员工的迟到行为给公司造成了经济损失，比如影响了生产进度、导致了订单交付的延迟等。
- 扣除的罚款金额应该在合理弥补这些损失的范围内。如果罚款金额过高，超出了实际损失的范围，那么这种罚款行为可能被视为不合理。
与薪酬结构和整体待遇匹配：
- 如果公司的整体薪酬水平较高，员工对迟到罚款的规定有清晰的了解并表示接受，同时公司在其他方面也给予了员工较好的福利待遇，那么迟到一次罚款100元可能被视为合理。
- 相反，如果公司的薪酬水平较低，迟到罚款占员工收入的比例较大，那么这种罚款规定可能就显得不太合理。
三、劳动者权益保护
- 如果您认为公司的罚款行为不合理或不合法，首先可以尝试与公司进行沟通协商，表达您的观点和诉求。
- 如果协商不成，您可以向当地的劳动监察部门投诉，或者申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。
总结与建议
综上所述，公司迟到一次罚款100元是否合法，需要综合考虑规章制度的合法性、罚款的合理性及其与实际损失的关联性，以及薪酬结构和整体待遇的匹配度。在面对此类问题时，我建议您：
- 仔细了解公司的规章制度，特别是关于迟到罚款的规定。
- 评估罚款金额是否合理，是否与您的实际损失相匹配。
- 如果认为罚款行为不合理或不合法，及时与公司沟通协商，或寻求法律援助来维护自己的权益。
希望以上分析能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的解答，请随时告诉我。