结论：内退期间取消住房基金是否合法，需根据具体情况判断，包括住房基金的性质、单位规章制度以及劳动合同或集体合同的约定等。以下从不同角度进行分析：
一、住房基金的性质与来源
住房公积金：
- 住房公积金是由国家机关、国有企业、城镇集体企业、外商投资企业、城镇私营企业及其他城镇企业、事业单位、民办非企业单位、社会团体（以下统称单位）及其在职职工缴存的长期住房储金。
- 根据《住房公积金管理条例》的规定，单位应当按时、足额缴存住房公积金，不得逾期缴存或者少缴。职工个人缴存的住房公积金和职工所在单位为职工缴存的住房公积金，属于职工个人所有。
- 若住房基金指的是住房公积金，则单位在内退期间取消或停缴住房公积金可能涉嫌违法，因为这违反了《住房公积金管理条例》中关于按时、足额缴存的规定。
单位内部住房基金：
- 有些单位可能设立有内部住房基金，用于帮助职工解决住房问题，这部分基金的性质和来源可能因单位而异。
- 若住房基金是单位内部设立的福利，其取消或调整可能受单位规章制度或劳动合同、集体合同的约束。如果单位规章制度或相关合同中明确规定了内退期间住房基金的待遇，且单位未经合法程序擅自取消，则可能构成违约或违法。
二、单位规章制度与劳动合同、集体合同的约定
单位规章制度：
- 单位规章制度是单位内部管理的重要依据，但必须符合法律法规的规定，且经过民主程序制定并公示。
- 如果单位规章制度中明确规定了内退期间住房基金的待遇，且该制度合法有效，则单位应遵守执行。擅自取消可能面临法律责任。
劳动合同与集体合同：
- 劳动合同是劳动者与用人单位之间确立劳动关系、明确双方权利和义务的协议。集体合同则是工会或职工代表与用人单位之间就劳动报酬、工作时间、休息休假、劳动安全卫生、保险福利等事项签订的协议。
- 如果劳动合同或集体合同中明确约定了内退期间住房基金的待遇，则单位应履行合同义务。擅自取消可能构成违约，劳动者有权要求单位继续履行或承担违约责任。
三、法律建议与后续行动
审查相关文件：
- 建议您首先审查单位规章制度、劳动合同以及集体合同中关于住房基金的条款，明确自己的权益。
与单位协商：
- 如果发现单位擅自取消了住房基金，您可以先与单位进行协商，了解取消的原因和依据，并尝试达成和解。
寻求法律援助：
- 如果协商无果，您可以向当地的劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。在此过程中，如有需要，也可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律建议。
总结：内退期间取消住房基金是否合法，需根据住房基金的性质、单位规章制度以及劳动合同或集体合同的约定来判断。如果单位擅自取消且违反了相关法律法规或合同约定，您有权通过法律途径维护自己的权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。