结论：单位过了工伤认定书六个月后提起行政诉讼，一般情况下不能直接阻止工伤认定书的效力或后续赔偿程序，但具体能否阻止需视行政诉讼的审理结果而定。以下从多个角度进行详细分析：
一、工伤认定书的法律效力
工伤认定书是劳动保障行政部门根据《工伤保险条例》的规定，对职工因工作遭受事故伤害或者患职业病是否属于工伤或者视同工伤给予的定性。一旦作出并送达，即具有法律效力，用人单位和职工均应遵守。
二、行政诉讼的提起与影响
提起行政诉讼的条件：
- 用人单位或职工对工伤认定结论不服的，可以在收到工伤认定书之日起60日内，向作出工伤认定决定的劳动保障行政部门的本级人民政府或上一级劳动保障行政部门申请行政复议；
- 对行政复议决定不服的，可以在收到行政复议决定书之日起15日内，向人民法院提起行政诉讼；
- 若直接提起行政诉讼，则应在收到工伤认定书之日起6个月内提出。
行政诉讼对工伤认定书的影响：
- 行政诉讼期间，工伤认定书原则上并不停止执行，即其法律效力不受影响；
- 但若法院认为需要停止执行的，或者原告申请停止执行且法院认为停止执行不损害国家利益、社会公共利益和他人合法权益的，可以裁定停止执行。
三、行政诉讼能否阻止赔偿程序
一般情况下不能阻止：
- 行政诉讼的提起，并不直接导致工伤认定书的无效或赔偿程序的停止；
- 赔偿程序通常基于工伤认定书的结论进行，若工伤认定书未被撤销或变更，赔偿程序应继续进行。
特殊情况下可能阻止：
- 若法院在行政诉讼中裁定停止执行工伤认定书，或者最终判决撤销或变更工伤认定书，则可能影响赔偿程序的进行；
- 但这种情况下，赔偿程序的停止或变更是基于法院的判决，而非行政诉讼的提起本身。
四、建议与措施
对于用人单位：
- 若对工伤认定结论不服，应及时在法定期限内申请行政复议或提起行政诉讼；
- 在行政诉讼期间，应继续履行相关义务，如支付工伤职工的医疗费用等；
- 密切关注行政诉讼的进展，及时根据法院的判决调整策略。
对于工伤职工：
- 若收到工伤认定书，应确认其内容是否准确无误；
- 若用人单位提起行政诉讼，不必过于担心，因为行政诉讼的提起并不直接导致工伤认定书的无效；
- 可积极关注行政诉讼的进展，必要时可寻求法律援助或咨询专业律师。
总结来说，单位过了工伤认定书六个月后提起行政诉讼，并不能直接阻止工伤认定书的效力或后续赔偿程序。但行政诉讼的审理结果可能对工伤认定书的效力和赔偿程序产生影响。因此，建议用人单位和工伤职工都应密切关注行政诉讼的进展，并根据法院的判决及时调整策略。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。