工伤认定书过了6个月，公司通常不能直接通过行政诉讼来推翻原工伤认定结论，但存在特殊情况或可尝试其他救济途径。以下是对此问题的详细分析：
一、一般情况下的行政诉讼时效
根据《中华人民共和国行政诉讼法》第四十六条的规定，公民、法人或者其他组织直接向人民法院提起诉讼的，应当自知道或者应当知道作出行政行为之日起六个月内提出。这意味着，在正常情况下，如果公司对工伤认定结论不服，应当在收到工伤认定决定书之日起六个月内向人民法院提起行政诉讼。超过这一期限，人民法院可能不予受理。
二、特殊情况下的起诉期限延长
不可抗力或其他不属于自身的原因耽误起诉期限：
- 如果因不可抗力（如自然灾害、突发事件等）或被限制人身自由等特殊原因导致错过诉讼时效，根据法律规定，耽误的时间不计算在起诉期限内。公司应提供相关证据，并向法院说明情况，申请恢复诉讼权利。
最长保护期限：
- 行政行为涉及不动产的，因不动产提起诉讼的案件自行政行为作出之日起超过二十年，其他案件自行政行为作出之日起超过五年提起诉讼的，人民法院不予受理。但这一条款主要针对未被告知诉权或起诉期限的情况，且为最长保护期限，非通常意义上的起诉期限。在工伤认定的情况下，这一最长保护期限并不直接适用，但可作为参考，说明法律对起诉期限有严格限制。
三、超过诉讼时效后的救济途径
申请复查鉴定：
- 如果伤情有新变化或符合复查鉴定条件，公司可申请劳动能力复查鉴定，并根据新的鉴定结果重新主张相应待遇。但这并不直接解决工伤认定结论的争议，而是针对工伤待遇的重新评估。
与劳动者协商：
- 尽管超过了诉讼期，但公司仍可与劳动者基于公平、合理原则就工伤待遇问题进行协商，达成双方都能接受的赔偿协议。这有助于化解纠纷，减少法律成本。
寻求信访途径：
- 公司可以向相关政府部门信访，反映自身情况，请求协调解决。相关部门可能会根据实际情况，督促劳动者与公司协商处理或促成合理的解决方案。
考虑提起民事诉讼（针对工伤保险待遇争议）：
- 如果工伤认定过了行政诉讼时效，但公司认为劳动者应承担一定责任或工伤保险待遇存在争议，且仍在民事诉讼时效内（一般为三年），公司可以考虑向人民法院提起民事诉讼，请求劳动者承担相应责任或就工伤保险待遇进行争议解决。但需注意，这并非直接针对工伤认定结论的诉讼，而是针对工伤保险待遇的民事争议。
四、注意事项
- 诉讼时效的严格性：公司应严格遵守诉讼时效的规定，避免因错过时效而丧失法律救济的机会。
- 证据的收集与保存：在整个过程中，公司应收集并保存好相关证据，如工伤认定决定书、医疗证明、劳动合同等，以支持自身主张。
- 法律咨询的重要性：由于法律问题具有复杂性和专业性，公司在处理此类纠纷时，建议直接向我咨询，以获取更具体的法律建议和支持。
综上所述，工伤认定书过了6个月后，公司通常不能直接通过行政诉讼来推翻原工伤认定结论。但公司仍可尝试其他救济途径来维护自身权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我提问。