综合工时制下，劳动者的工作时间及加班费支付规定如下：
一、综合工时制下工作时间的上限
在综合工时制下，劳动者的工作时间并非无限制。根据相关规定，综合计算周期内的总实际工作时间不应超过总法定标准工作时间。具体来说，如果综合计算周期为周、月、季、年，那么在该周期内，劳动者的总工作时间应分别不超过周、月、季、年的法定标准工作时间。例如，若以周为周期，则一周内总工作时间不应超过40小时（标准工时制下的周工作时间）；若以月为周期，则一个月内总工作时间不应超过167.36小时（即20.92天×8小时，考虑到法定假日的调整，实际计算可能略有不同，但此处为简化说明）。超过部分，应视为延长工作时间，即加班。
二、加班费的支付规定
工作日加班：在综合工时制下，如果劳动者在综合计算周期内的总工作时间超过了法定标准工作时间，但并未超过该周期内的日或周平均工作时间（如周平均工作时间未超过40小时），则这部分超出时间通常不被视为加班，无需支付加班费。然而，如果劳动者在某个具体的工作日工作超过了8小时，且该超出部分在综合计算周期内未得到补休，则这部分时间应视为工作日加班，需支付不低于工资150%的加班费。
休息日加班：在综合工时制下，如果劳动者在休息日工作，但该工作并未导致综合计算周期内的总工作时间超过法定标准工作时间，则这部分时间通常不被视为加班，因为劳动者在综合计算周期内已经得到了足够的休息时间。但是，如果休息日工作且未安排补休，同时导致综合计算周期内的总工作时间超过了法定标准工作时间，则超出部分应视为休息日加班，需支付不低于工资200%的加班费。不过，在实际操作中，由于综合工时制的特殊性，休息日加班的认定可能更为复杂，需结合具体情况判断。
法定节假日加班：无论劳动者在综合计算周期内的总工作时间是否超过法定标准工作时间，只要劳动者在法定节假日工作，就应视为法定节假日加班，需支付不低于工资300%的加班费。
三、特殊情况说明
综合计算周期内的调休：在综合工时制下，用人单位可以在保障劳动者身体健康的前提下，与劳动者协商一致后安排调休。如果劳动者在综合计算周期内的某些天工作超过了标准时间，但在其他天得到了相应的补休，且综合计算周期内的总工作时间未超过法定标准工作时间，则这部分超出时间无需支付加班费。
加班时间的累计与限制：虽然综合工时制允许在一定周期内灵活安排工作时间，但劳动者的加班时间仍受到一定限制。例如，根据相关规定，劳动者每日加班一般不得超过1小时，特殊原因下也不得超过3小时，且每月加班时间累计不得超过36小时。这些限制同样适用于综合工时制下的劳动者。
总结来说，在综合工时制下，劳动者的工作时间应受到严格限制，以确保其身心健康和工作效率。对于加班费的支付，需根据具体情况判断是否属于加班以及加班的类型（工作日、休息日或法定节假日），并按照规定支付相应的加班费。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。