针对您提出的“对方公司已认证增值税发票但不付款，如何发律师函”的问题，核心结论是：您可以委托律师起草一份正式、严谨且具有法律效力的律师函，明确要求对方公司履行付款义务，并告知其不履行的法律后果。以下是对此问题的详细分析和建议：

1. 律师函的作用与目的：

   • 律师函是律师代表委托人向对方发出的正式法律文件，旨在通过法律手段促使对方履行义务或停止侵权行为。
   • 在您的情况下，律师函可以明确告知对方公司，其已认证增值税发票但未付款的行为构成违约，要求其立即支付款项，并可能承担因此产生的法律责任。

2. 律师函的内容要点：

   • 双方信息：包括您公司（委托人）和对方公司的名称、地址、联系方式等。
   • 事实陈述：清晰、准确地陈述对方公司已认证增值税发票但未付款的事实，包括发票的开具时间、金额、认证情况等。
   • 法律依据：引用相关法律法规，如《中华人民共和国合同法》、《中华人民共和国增值税暂行条例》等，说明对方公司的行为构成违约，并应承担的法律责任。
   • 要求与警告：明确要求对方公司在一定期限内（如7日、15日等）支付款项，并告知其如不履行将采取的法律措施，如提起诉讼、申请强制执行等。
   • 律师信息：包括起草律师的姓名、执业证号、联系方式等，以彰显律师函的正式性和法律效力。

3. 律师函的起草与发送：

   • 您应委托一位具有丰富经验的律师来起草律师函，确保内容严谨、合法、有效。
   • 律师函应以书面形式发送，并通过邮寄、电子邮件或传真等方式送达对方公司，并保留好送达凭证。
   • 在发送律师函前，建议您与律师充分沟通，确保律师函的内容符合您的实际需求和法律要求。

4. 后续措施与建议：

   • 如果对方公司在收到律师函后仍未履行付款义务，您可以考虑采取进一步的法律措施，如提起诉讼或申请仲裁等。
   • 在此过程中，建议您保持与律师的密切沟通，及时了解案件进展情况，并根据律师的建议调整策略。
   • 同时，您也应做好证据收集和整理工作，如保存好增值税发票、合同、往来函件等，以备不时之需。

针对您的情况，我建议您尽快委托一位专业律师来起草并发送律师函，以维护您的合法权益。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。