当增值税发票已开但对方未付款时，您可以按照以下步骤来妥善处理这一问题，以确保您的权益得到维护：
一、初步核实与友好协商
核对发票与合同：
- 首先，确认发票的内容（如金额、商品/服务描述、税率等）与合同中的约定完全一致。
- 检查发票是否已正确送达对方，并保留邮寄记录、签收凭证或电子发票的接收确认。
友好沟通：
- 通过电话、邮件或书面函件礼貌地询问对方付款的进度，避免直接指责，以保持良好的商业关系。
- 在沟通中，可以设定一个明确的付款截止日期，并告知对方如果未能在该日期前付款，可能会采取的后续措施。
二、正式催款与证据收集
发送催款函：
- 如果友好沟通未果，可以发送一份正式的催款函。催款函应详细列出发票号码、开票日期、应付款金额、付款期限以及逾期不付款的后果。
- 催款函可以通过邮寄（保留快递单号）或电子邮件（保留发送记录）的方式发送，确保对方能够收到。
收集证据：
- 在整个过程中，务必保留所有与交易相关的证据，包括合同、发票副本、沟通记录、催款函及回执等。
- 这些证据在后续可能采取的法律行动中至关重要。
三、法律途径与诉讼准备
评估法律风险：
- 在考虑采取法律途径之前，建议先评估诉讼时效（一般为3年）以及胜诉的可能性和执行难度。
申请支付令或提起诉讼：
- 如果债权债务关系明确且无其他纠纷，可以向法院申请支付令，要求对方限期偿还债务。
- 如果支付令无效或情况更复杂，可以准备起诉状和证据材料，向法院提起诉讼。
申请强制执行：
- 如果法院判决胜诉但对方仍不履行付款义务，可以在规定时间内向法院申请强制执行，如查封资产、拍卖财产等。
四、特殊注意事项与预防措施
税务风险：
- 开具发票后即产生纳税义务，即使未收款也需申报销项税额。因此，要密切关注应收账款的清理，避免长期挂账引发税务机关的关注。
信用管理：
- 将未付款的客户列入黑名单，并在未来的合作中保持谨慎。同时，可以向征信机构报告欠款行为，影响其商业信誉。
预防措施：
- 完善合同管理，明确付款条件、违约责任及争议解决方式。
- 在合作前进行客户资信调查，选择信誉良好的合作伙伴。
- 考虑分阶段开票或要求客户提供担保（如保证金、银行保函）以降低风险。
综上所述，面对增值税发票已开但对方未付款的情况，您应首先尝试通过友好协商和正式催款来解决；如果无效，则应及时收集证据并采取法律途径或其他补救措施来维护自身权益。同时，加强内部管理和风险控制也是预防类似纠纷发生的关键。