结论：公司不能仅因员工未退回劳保鞋就扣工资，除非双方有明确约定且该约定合法合理。
分析如下：
工资与劳保鞋的性质：
- 工资是员工因提供劳动而应得的报酬，属于员工的合法财产。
- 劳保鞋是公司为员工提供的劳动保护用品，其所有权通常归公司所有，但员工在劳动关系存续期间享有使用权。
公司扣工资的合法性：
- 根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，公司不得随意克扣员工工资。工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠。
- 如果公司想要因员工未退回劳保鞋而扣工资，必须基于双方之间的明确约定，且该约定不得违反法律法规的强制性规定，也不得显失公平。
双方约定的必要性：
- 如果公司在员工入职时或发放劳保鞋时，与员工明确约定了劳保鞋的退回义务以及未退回的后果（包括可能扣工资），且该约定合法合理，那么公司有权按照约定执行。
- 如果没有这样的约定，或者约定不明确、不合法，公司就不能仅凭员工未退回劳保鞋就扣工资。
实际操作建议：
- 对于公司而言，应当在发放劳保鞋时与员工签订书面协议，明确劳保鞋的退回义务、期限以及未退回的后果。
- 对于员工而言，如果公司要求退回劳保鞋，应当积极配合；如果公司因此扣工资，且认为扣工资行为不合法或不合理，可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
可能的情况与后果：
情况一：双方有明确约定且约定合法合理。
- 后果：公司有权按照约定扣工资，但扣工资的金额应当合理，不得超过员工应得工资的合理比例。
情况二：双方没有约定或约定不明确、不合法。
- 后果：公司无权扣工资，如果扣了，员工有权要求公司返还被扣的工资，并可能因此获得相应的赔偿。
总结与建议：
公司不能仅因员工未退回劳保鞋就随意扣工资。如果公司想要避免此类纠纷，应当在发放劳保鞋时与员工签订明确的书面协议。如果员工遇到公司因此扣工资的情况，且认为扣工资行为不合法或不合理，应当及时咨询专业律师（即我，梁静律师，专注于婚姻家庭、劳动纠纷领域）或向当地劳动监察部门投诉、申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。