在违法的公司做事是否会被牵连，这主要取决于违法行为的性质、你的参与程度以及法律的具体规定。以下是对此问题的详细分析：
直接责任牵连：
- 如果你直接参与了公司的违法行为，比如财务造假、商业贿赂、偷税漏税等，那么你将需要承担相应的法律责任。这可能包括刑事责任，如被判刑或罚款，以及行政责任，如被吊销执业资格或受到行政处罚。例如，若你作为财务人员协助公司伪造账目，一旦被发现，你将面临法律的制裁。
间接责任牵连：
- 即使你没有直接参与违法行为，但如果你的职务行为导致了损害后果，或者你应当知道违法行为却未采取措施阻止，你也可能承担一定的连带责任。这通常发生在管理岗位或关键岗位的员工身上，他们因疏忽或故意不作为而导致了违法后果的发生。例如，若你作为项目负责人，在明知存在安全隐患的情况下仍推进工程，导致事故发生，你将需要承担相应的责任。
职业声誉受损：
- 公司的违法行为一旦曝光，即使你并未直接涉事，你的职业形象也可能受到负面影响。这可能会影响你未来的求职竞争力或职业发展。例如，若你所在的药企因虚假宣传被处罚，即使你并未参与宣传活动，你的职业声誉也可能因此受损。
经济利益损失：
- 公司的违法行为可能导致资金链断裂或破产，进而影响你的薪资发放和福利保障。此外，若你因参与违法行为而遭受财产损失，如被要求退还非法所得或赔偿损失，你的经济利益将受到进一步损害。例如，在P2P平台爆雷后，员工不仅面临失业风险，还可能因参与非法集资而遭受财产损失。
针对不同情况，以下是一些具体的法律建议：
保持警惕与独立判断：
- 在工作中，要对异常业务指令保持警惕，核实其合法性。对于明显违法的任务，要坚决拒绝执行。例如，若你被要求篡改实验数据或参与非法集资活动，应立即向上级或相关部门报告。
留存证据以自保：
- 通过邮件、聊天记录等方式保存履职证明，以便在需要时证明自己的清白。例如，在会议纪要中明确记录自己的反对意见或提出的风险警示。
及时寻求法律援助：
- 若你发现公司存在违法行为或自己可能因此受到牵连，应及时咨询律师，评估自身风险并制定应对策略。律师可以根据你的具体情况提供专业的法律意见和帮助。
主动切割风险：
- 在不扩大损失的前提下，尽量脱离违法活动。必要时，可以向监管部门举报公司的违法行为。例如，若你发现公司存在传销行为或环境污染问题，应立即离职并报案。
法律依据：
- 《中华人民共和国刑法》第三十条和第三十一条规定了企业犯罪及直接负责的主管人员和其他直接责任人员的刑事责任。这意味着，若你直接参与了公司的违法行为，你将面临刑事责任的追究。
- 《最高人民法院关于审理单位犯罪案件具体应用法律有关问题的解释》也明确了单位犯罪的认定标准和责任承担方式。这有助于你了解在公司违法行为中可能承担的法律责任。
综上所述，在违法的公司做事是否会被牵连取决于多种因素。为了保护自己的合法权益，建议你保持警惕、留存证据、及时寻求法律援助并主动切割风险。若你有任何具体的法律问题或需要进一步的帮助，请直接向我咨询。