员工病假3个月，其工资发放需依据具体情况来确定，但无论如何，病假工资不得低于当地最低工资标准的80%。以下是对此问题的详细分析：
一、法律依据
根据原劳动部《关于贯彻执行〈中华人民共和国劳动法〉若干问题的意见》第59条规定，职工患病或非因工负伤治疗期间，在规定的医疗期间内，企业应按有关规定支付其病假工资或疾病救济费，且该费用不得低于当地最低工资标准的80%。这是员工在病假期间获得工资或疾病津贴的法律依据。
二、工资发放标准
劳动合同有约定：
- 若用人单位和劳动者在劳动合同中已就病假工资进行约定，则按合同约定执行。但需要注意的是，约定标准不得低于当地最低工资标准的80%，以保障员工的基本生活需求。
劳动合同无约定：
- 双方未在合同中约定时，通常遵循当地的具体规定。不同地区的计算基数和方式可能有所不同，可能基于员工正常出勤月工资的一定比例，或根据工作年限来确定支付比例。例如，有些地区可能规定，连续工龄不满2年的，按本人工资的60%计发；连续工龄满2年不满4年的，按70%计发等。
特殊地区政策：
- 除了上述一般规定外，一些地区还有更为具体的政策。如上海等地，对病假工资的发放有更为详细的规定，员工应了解并遵循当地的具体政策。
三、特殊情况处理
医疗期满：
- 员工病假超过规定的医疗期，且不能从事原工作或用人单位另行安排的工作时，用人单位可解除劳动合同，但需支付经济补偿。在医疗期内，用人单位仍需按规定支付病假工资，以保障员工的基本生活。
公司政策与调整：
- 长时间病假可能对公司运营产生影响，因此一些公司可能会采取调整工作岗位或终止劳动合同等措施。但这并不影响员工在病假期间获得病假工资的权利。具体处理需依据当地法律和公司政策进行，员工应了解并维护自己的合法权益。
四、实际操作建议
- 了解当地政策：员工在病假期间应了解自己所在地区的劳动法和公司相关政策，特别是关于病假工资发放的规定，以确保自己的权益得到保障。
- 保留相关证据：在申请病假和领取病假工资过程中，员工应妥善保留相关证据，如病历、诊断证明、请假条等，以备不时之需。这些证据在维护自己权益时可能起到关键作用。
- 及时沟通协商：若对病假工资发放标准或流程有疑问或异议，员工应及时与单位的人力资源部门或相关负责人进行沟通协商，以寻求合理的解决方案。
综上所述，员工病假3个月时，其工资发放需依据劳动合同约定、当地政策以及公司规定来确定。无论如何，病假工资都不得低于当地最低工资标准的80%。员工应了解并维护自己的合法权益，如有疑问或争议，可直接向我咨询。