关于药房员工请病假三个月的工资发放问题，首先需明确的是，具体的工资发放方式会依据所在地的劳动法规、公司的规章制度以及劳动合同中的相关条款而有所不同。以下是一般情况下的处理原则和建议：

1. 依据劳动法规和劳动合同：

   • 查阅所在地的劳动法规，特别是关于病假工资的规定。
   • 检查劳动合同中是否有关于病假工资的具体约定，如有，则按约定执行。

2. 公司规章制度：

   • 参考公司的员工手册或规章制度，了解公司对病假工资的具体规定。
   • 规章制度中通常会明确病假期间的工资计算方法、支付比例以及支付期限等。

3. 一般处理原则：

   • 在病假期间，员工通常有权获得一定比例的工资，这个比例可能因地区和公司政策而异。
   • 病假工资可能会根据员工的工龄、职位以及病假期间的长短而有所调整。
   • 如果病假期间跨越了不同的薪资周期，需要分别计算每个周期内的病假工资。

4. 特殊情况处理：

   • 如果员工在病假期间提供了医疗证明或医生建议，且符合公司规定，可能会获得更高的病假工资比例。
   • 如果员工的病假是由于工伤或职业病导致的，那么工资发放应遵循工伤赔偿的相关规定。

5. 建议与注意事项：

   • 员工在请病假前，应与公司的人力资源部门或相关负责人沟通，明确病假期间的工资待遇。
   • 公司应确保病假工资的发放符合当地的劳动法规和公司的规章制度。
   • 如对病假工资的发放存在疑问或争议，员工可以与公司协商解决，或寻求劳动仲裁机构的帮助。

综上所述，药房员工请病假三个月的工资发放方式需根据当地的劳动法规、公司的规章制度以及劳动合同中的相关条款来确定。建议员工在请病假前与公司明确工资待遇，以确保自己的权益得到保障。如有任何疑问或争议，应及时与公司沟通或寻求法律援助。