国企员工因旷工被扣工资或申请工资相关事宜，需根据具体情况及企业内部规章制度处理，核心结论如下：

1. 旷工期间工资扣除的合法性
   根据《工资支付暂行规定》第十六条，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求赔偿，并从工资中扣除，但每月扣除部分不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后剩余工资不得低于当地最低工资标准。

   • 若企业规章制度明确规定旷工扣薪规则（如旷工一天扣当日工资的200%等），需审查该制度是否经民主程序制定（如职工代表大会讨论）、是否公示或告知员工。若符合法定程序，企业可依据制度扣薪，但扣除比例仍需受前述20%限制。
     
   • 若制度未明确或程序违法，企业擅自扣薪可能构成违法克扣工资，员工可主张补发工资并要求赔偿。

2. 旷工员工申请工资的流程

   • 第一步：核实企业扣薪依据
     要求企业提供书面扣薪通知及制度依据，确认扣薪是否符合劳动合同约定或规章制度。若企业无法提供合法依据，员工可拒绝扣薪并主张全额发放工资。
     
   • 第二步：与企业协商或申诉
     通过工会或内部申诉渠道与企业沟通，要求说明扣薪理由及计算方式。若企业拒绝沟通或协商无果，可进入下一步。
     
   • 第三步：申请劳动仲裁
     向当地劳动争议仲裁委员会提交仲裁申请，主张企业支付被扣工资及可能的赔偿金（如50%-100%加付赔偿金）。需提供劳动合同、工资条、考勤记录、扣薪通知等证据。
     
   • 第四步：提起诉讼（如仲裁败诉）
     对仲裁结果不服的，可在15日内向法院提起诉讼，继续主张权益。

3. 特殊情形处理

   • 旷工被解除劳动合同：若企业以旷工严重违反规章制度为由解除劳动合同，员工除申请工资外，还可主张违法解除赔偿金（2N）或要求继续履行合同（若解除违法）。
     
   • 最低工资保障：即使旷工，企业扣除后工资也不得低于当地最低工资标准，否则需补足差额。

建议：

• 保留所有与工资、考勤、企业制度相关的证据（如邮件、短信、纸质文件等）。
  
• 若企业扣薪行为明显违法（如扣除比例超标、无制度依据），可优先向劳动监察部门投诉（时效2年），效率高于仲裁。
  
• 具体操作需结合企业所在地劳动法规（如部分地区对旷工扣薪有更细规定），如有疑问可直接向我咨询。