关于“住建局系统交两金是否合法”的问题，这需要从多个角度来理解和分析。

首先，我们需要明确“两金”的具体含义。在物业或房地产领域，“两金”通常可能指的是维修资金和保证金，或者是其他与物业或房地产相关的特定资金。不过，由于“两金”的具体定义可能因地区和政策而异，因此，在解答这个问题时，我们需要基于一般的理解和政策背景来进行分析。

接下来，我们来看住建局系统交“两金”的合法性。

1. 政策依据：

   • 从提供的参考信息中，我们可以看到衢州市衢江区住建局有一个关于“物业两金竞争性存放项目”的招标公告。这表明，在某些地区或特定情境下，住建局确实会涉及“两金”的管理和存放，但这并不直接说明交“两金”的合法性，而是说明了住建局在“两金”管理方面的某种操作方式。
   • 要判断交“两金”是否合法，我们需要查看具体的政策文件或法律法规。虽然提供的参考信息中没有直接相关的政策文件，但通常这类政策会由地方政府或相关部门制定，并会明确规定“两金”的缴纳、管理、使用等方面的要求。

2. 合法性分析：

   • 在一般情况下，如果“两金”的缴纳是基于地方政府的政策要求，并且这些政策要求符合国家法律法规的规定，那么交“两金”就是合法的。
   • 例如，维修资金通常用于物业共用部位、共用设施设备的维修和更新、改造，这是保障物业长期使用和居民生活质量的重要措施。如果地方政府要求业主缴纳维修资金，并且这些资金的使用和管理都受到严格监管，那么这种缴纳就是合法的。
   • 同样，如果保证金是为了确保某种义务或责任的履行而缴纳的，并且其缴纳、退还等条件都明确规定在政策文件中，那么这种缴纳也是合法的。

3. 实际操作建议：

   • 如果您对交“两金”的合法性有疑问，建议您首先查阅当地政府或相关部门发布的政策文件或法律法规，了解“两金”的具体定义、缴纳要求、管理方式等。
   • 如果您仍然有疑问或不确定，可以咨询当地的住建局或相关法律专业人士，以获取更准确和权威的解答。

综上所述，住建局系统交“两金”是否合法，取决于具体的政策文件和法律法规要求。在一般情况下，如果“两金”的缴纳是基于合法有效的政策要求，并且这些要求符合国家法律法规的规定，那么交“两金”就是合法的。