结论前置：支付未休年休假工资时，不可以扣除加班费。未休年休假工资报酬是按照员工日工资收入的300%来支付的，其中已包含员工正常工作期间的工资收入，因此实际额外支付的金额为日工资收入的200%，这部分与加班费是独立的，不应相互扣除。
法律依据与详细分析
未休年休假工资的计算方式：
- 根据《职工带薪年休假条例》第五条及《企业职工带薪年休假实施办法》的相关规定，单位因工作需要不能安排职工休年休假的，应对职工应休未休的年休假天数，按照其日工资收入的300%支付年休假工资报酬。
- 日工资收入应按照职工本人的月工资除以月计薪天数（通常为21.75天）进行折算。这里的月工资指的是职工在用人单位支付其未休年休假工资报酬前12个月剔除加班工资后的月平均工资。
实际支付金额与加班费的关系：
- 虽然未休年休假工资是按照日工资收入的300%支付，但这其中已经包含了员工正常工作期间的工资收入。因此，实际上公司需要额外支付的金额为日工资收入的200%。
- 加班费是员工在超出正常工作时间外工作所应得的报酬，与未休年休假工资是两个独立的概念，不应相互扣除。
员工个人选择的影响：
- 如果员工因个人原因书面提出不休年休假，那么用人单位可以只支付其正常工作期间的工资收入，无需支付额外的未休年休假工资报酬。但这一情况与加班费无关，加班费仍应按照实际加班情况支付。
维权途径与证据准备
- 与公司协商：如果公司未按照法律规定支付未休年休假工资报酬，员工可以首先尝试以书面或口头方式向公司提出支付要求，并说明法律依据。
- 向劳动监察部门投诉：若协商无果，员工可以向当地劳动监察部门投诉，由其对公司进行调查并责令改正。
- 申请劳动仲裁：如问题仍未解决，员工可以在知道或应当知道自己权利被侵害之日起一年内，向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。
- 证据准备：为维护自身权益，员工应准备好劳动合同、工资条、考勤记录、年休假申请记录等相关证据，以证明自己的工作情况和未休年休假的事实。
示例说明
假设某员工的月工资为5000元，月计薪天数为21.75天，那么其日工资收入为5000元/21.75天≈229.89元。如果该员工有5天未休年休假，那么公司应支付的未休年休假工资报酬为229.89元/天×300%×5天=3448.35元，其中实际额外支付的金额为229.89元/天×200%×5天=2298.9元。这部分金额与员工的加班费是独立的，不应相互扣除。
综上所述，支付未休年休假工资时不可以扣除加班费。如果公司未按照法律规定支付未休年休假工资报酬，员工可以通过多种途径维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。