结论：工资表中包含加班费本身是合法的，但如果加班费的计算或支付存在违法情形，劳动者是可以申请劳动仲裁的。

详细分析：

1. 工资表中包含加班费的合法性：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，劳动者在正常工作时间之外加班的，用人单位应当支付加班费。加班费是劳动者劳动报酬的一部分，因此，在工资表中体现加班费是合法的，也是用人单位履行支付义务的一种方式。
   • 工资表作为记录劳动者工资支付情况的凭证，应当详细、准确地反映劳动者的工资构成，包括基本工资、加班费、奖金等。所以，工资表中包含加班费不仅合法，也是必要的。

2. 加班费计算或支付违法情形下的仲裁：

   • 如果用人单位在计算加班费时存在违法行为，如未按照法定标准计算、未支付或未足额支付加班费等，劳动者有权向劳动仲裁机构申请仲裁。
   • 劳动仲裁机构将依据相关法律法规，对用人单位的加班费支付情况进行审查，并作出裁决。如果裁决用人单位存在违法行为，用人单位需要补发加班费，并可能面临其他法律责任。

3. 申请劳动仲裁的流程与注意事项：

   • 流程：劳动者在发现用人单位存在加班费支付违法行为后，应首先与用人单位协商解决；协商不成的，可以向当地劳动仲裁机构申请仲裁。申请仲裁时，需要提交仲裁申请书、相关证据材料等。
   • 注意事项：劳动者在申请仲裁前，应确保自己掌握了充分的证据，如工资条、考勤记录、加班通知等，以证明用人单位存在加班费支付违法行为。同时，劳动者也应注意仲裁时效问题，一般应在知道或应当知道权利被侵害之日起一年内申请仲裁。

建议：

• 对于劳动者而言，如果发现工资表中加班费的计算或支付存在疑问，应及时与用人单位沟通并要求解释。如果沟通无果，可以寻求法律援助或向劳动仲裁机构申请仲裁。
• 对于用人单位而言，应严格遵守相关法律法规，确保加班费的计算和支付合法合规。同时，也应加强内部管理，完善工资支付制度，避免因加班费问题引发劳动纠纷。

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