结论：公司因生产淡季安排星期六不上班而扣除工资的做法，一般是不合法的。具体分析如下：
法律背景与规定
根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，劳动者享有取得劳动报酬的权利，且工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。同时，对于月薪制员工，其工资通常已经包含了正常工作日的劳动报酬，而正常工作日一般是指每周工作五天，每天八小时的工作时间。星期六作为休息日，除非有特别约定或法律规定需要加班，否则劳动者有权享受休息，且不应因此被扣除工资。
公司做法的合法性分析
若星期六为正常休息日：
- 在没有特别约定或法律规定的情况下，星期六是劳动者的正常休息日。公司因生产淡季安排星期六不上班，属于正常的生产安排调整，不应影响劳动者的工资收入。因此，公司扣除工资的做法是不合法的。
若星期六为加班日但后续安排补休：
- 如果公司之前安排劳动者在星期六加班，并承诺后续安排补休，那么在补休期间不支付工资是合理的，因为劳动者已经通过补休获得了相应的休息和报酬。但在此案例中，公司并未提及加班或补休的情况，而是直接因生产淡季安排休息并扣除工资，因此这一情形不适用。
若劳动合同或公司规章制度中有特别约定：
- 如果劳动合同或公司规章制度中明确规定了月薪制员工在特定情况下（如生产淡季）需要接受星期六不上班并扣除相应工资的安排，且这种安排不违反法律、行政法规的强制性规定，那么公司扣除工资的做法可能是合法的。但这种情况较为特殊，且需要劳动者在签订劳动合同时或入职时明确知晓并同意。
法律建议
- 与公司协商：首先，建议劳动者与公司进行协商，了解公司扣除工资的具体原因和依据，并尝试达成和解。
- 向劳动监察部门投诉：如果协商无果，劳动者可以向当地的劳动监察部门投诉，寻求行政部门的帮助和支持。
- 申请劳动仲裁：如果投诉仍未解决问题，劳动者可以向劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁，通过法律途径维护自己的合法权益。
可能的法律后果
- 如果公司扣除工资的做法被认定为违法，公司可能需要补发被扣除的工资，并可能面临劳动行政部门的处罚。
- 对于劳动者而言，如果因公司违法扣除工资而遭受损失，还可以要求公司承担相应的赔偿责任。
综上所述，公司因生产淡季安排星期六不上班而扣除工资的做法，一般是不合法的。劳动者有权维护自己的合法权益，如有需要，可以直接向我咨询相关法律问题。