关于员工请假三个小时是否扣工资的问题，这主要取决于公司的规章制度以及请假类型，以下分情况讨论：

1. 事假情况：

   • 一般原则：员工请事假，原则上需要事先提出书面申请，并按照公司的请假审批管理制度履行审批手续。公司会根据实际情况决定是否批准。
   • 工资扣除：如果公司批准了员工的事假申请，并且公司规章制度中明确规定了事假期间不支付工资或者按一定比例扣除工资，那么公司可以按照规章制度执行。但扣除工资的比例应当合理，不能违反法律法规的强制性规定。例如，不能因为员工请了三个小时的事假就扣除一整天的工资。
   • 特殊情况：如果公司未批准员工的事假申请，而员工仍然缺勤，公司可以按照旷工处理。旷工期间，公司有权不支付工资，并且可能根据规章制度给予相应的纪律处分。

2. 病假、年假等其他假期情况：

   • 病假：如果员工因病请假三个小时，且提供了有效的医疗证明，那么根据相关法律法规，公司应当支付病假工资。病假工资的支付标准通常按照公司规章制度或者当地法律法规执行，但不得低于当地最低工资标准的80%。
   • 年假：如果员工使用年假请假三个小时，公司应当按照正常工资标准支付工资，因为年假是员工应享的带薪休假。

3. 公司规章制度的重要性：

   • 规章制度内容：公司规章制度是处理员工请假和工资扣除问题的重要依据。规章制度中应当明确规定请假的类型、审批程序、工资扣除标准等内容。
   • 规章制度合法性：公司规章制度必须合法有效，不能违反法律法规的强制性规定。如果规章制度中的规定与法律法规相冲突，那么该规定将无效，公司不能依据该规定扣除员工工资。

建议：

• 员工角度：在请假前，最好先了解公司的规章制度，明确请假的类型和审批程序。如果因特殊情况需要请假，尽量提前与公司沟通并获得批准。
• 公司角度：公司应当制定合法有效的规章制度，并明确告知员工。在处理员工请假和工资扣除问题时，应当严格按照规章制度执行，确保公平公正。

总结：员工请假三个小时是否扣工资，取决于请假类型、公司规章制度以及相关法律法规的规定。如果公司规章制度中有明确规定，并且规定合法有效，那么公司可以按照规章制度执行。如果员工对公司的处理有异议，可以与公司协商或者向劳动监察部门投诉。如有更多疑问，可以直接向我咨询。