结论：员工请假一天扣三天工资的做法通常是不合理的，这可能违反了劳动法的相关规定。
分析：
法律依据：
- 根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，员工的工资应当与其实际提供的劳动量相对应。请假是员工因个人原因暂时无法提供劳动的情况，用人单位在扣除工资时应当遵循合理、公平的原则。
- 具体来说，如果员工请假一天，用人单位通常只能扣除该员工当天的工资，而不能额外扣除其他天数的工资。除非双方在劳动合同或公司规章制度中有特别约定，且该约定不违反法律法规的强制性规定。
合理性分析：
- 从合理性角度来看，员工请假一天扣三天工资的做法显然对员工不利。这种做法可能构成对员工劳动权益的侵害，因为员工并未提供三天的劳动，却要承担三天的工资损失。
- 此外，如果这种做法成为公司的普遍规定或惯例，可能会引发员工的不满和抵触情绪，进而影响公司的团队凝聚力和工作效率。
可能的法律后果：
- 如果用人单位坚持执行这种不合理的扣工资规定，员工有权向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
- 在劳动仲裁或诉讼过程中，用人单位需要证明其扣工资的做法有合法依据且合理公平。如果无法证明，则可能面临支付违法扣除的工资、赔偿金等法律责任。
建议：
- 对于员工而言，如果遇到用人单位不合理扣工资的情况，应当及时与用人单位沟通协商，要求其纠正错误做法。
- 如果协商无果，员工可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。
- 对于用人单位而言，应当制定合理公平的请假和扣工资制度，并确保该制度符合法律法规的强制性规定。同时，用人单位还应当加强对员工的法律宣传和教育，提高员工的法律意识和维权意识。
特殊情况说明：
- 如果双方在劳动合同或公司规章制度中有特别约定，且该约定不违反法律法规的强制性规定（例如，约定了特定情况下的扣工资比例或方式），则用人单位可以按照约定执行。但即便如此，该约定也应当合理公平，不能过分损害员工的利益。
总之，员工请假一天扣三天工资的做法通常是不合理的。如果遇到这种情况，员工应当及时维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。