针对您提出的“三级智力精神残疾人被工厂人事科查出来怎么办”的问题，这确实是一个需要细致且合规处理的情况。以下是我为您提供的详细解答：
首先，我们要明确的是，三级智力精神残疾人属于无劳动能力的人群，根据特困人员救助供养的相关认定条件，这类人群在符合其他条件（如无生活来源、无法定赡养抚养扶养义务人或其法定义务人无履行义务能力）的情况下，应当依法纳入特困人员救助供养范围。这意味着，他们本身可能并不适合在工厂等劳动密集型场所工作，尤其是如果工作性质与他们的身体状况不匹配，可能会对其健康造成进一步的影响。
接下来，针对工厂人事科查出三级智力精神残疾人的情况，我建议采取以下步骤：
沟通与了解：
- 工厂人事科应首先与该员工进行沟通，了解其残疾情况、工作适应性以及是否自愿在此工作。
- 同时，也应了解该员工是否享受了相关的社会救助或福利政策，如特困人员救助供养等。
评估与调整：
- 根据沟通结果，工厂应评估该员工的工作岗位是否适合其身体状况。如果不适合，应考虑调整其工作岗位或提供必要的辅助措施，以确保其工作安全。
- 如果该员工确实无法适应工厂的工作环境，工厂应与其协商，探讨其他更适合的就业方式或安置途径。
合规处理：
- 工厂在处理此类情况时，必须严格遵守国家关于残疾人就业的相关法律法规，确保不侵犯残疾人的合法权益。
- 如果工厂发现该员工是被迫劳动或存在其他违法行为，应立即向相关部门报告，并配合调查处理。
提供支持与帮助：
- 工厂可以与当地残联、社会救助机构等联系，为该员工提供必要的支持和帮助，如职业培训、就业指导、社会救助等。
- 同时，也可以鼓励该员工及其家庭积极申请相关的社会救助政策，以改善其生活状况。
加强排查与预防：
- 工厂应加强对员工身体状况的排查和了解，确保所有员工都能在适合其身体状况的环境下工作。
- 同时，也应加强对残疾人就业政策的宣传和学习，提高工厂对残疾人就业问题的认识和重视程度。
最后，我想强调的是，保护残疾人的合法权益是全社会的共同责任。工厂在处理此类情况时，应秉持人道主义精神，积极为残疾人提供必要的支持和帮助，共同营造一个和谐、包容的社会环境。