结论：若您认为劳动仲裁赔偿基数按实发工资计算少了，且怀疑不是仲裁算错，而是存在其他计算或认定问题，您可以通过申请撤销仲裁裁决或向法院起诉来寻求救济。以下是对此问题的详细分析：
一、赔偿基数计算问题
赔偿基数的确定：
- 在劳动仲裁中，赔偿基数通常根据劳动者的工资水平来确定。工资水平一般指的是劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资。
- 如果实发工资与应发工资存在差异（如因社保、公积金、个税等扣除），赔偿基数一般应以应发工资为准，而非实发工资。但具体还需根据当地法律法规和仲裁实践来判断。
计算错误的可能性：
- 如果您认为仲裁机构在计算赔偿基数时存在错误，首先应仔细核对仲裁裁决书中的计算过程和依据。
- 确认是否考虑了所有应计入工资的项目（如奖金、津贴、补贴等），以及是否正确扣除了不应计入的项目（如非经常性奖金、一次性补偿等）。
二、救济途径
申请撤销仲裁裁决：
- 根据《劳动争议调解仲裁法》第四十九条的规定，用人单位有证据证明仲裁裁决存在适用法律、法规确有错误、劳动争议仲裁委员会无管辖权、违反法定程序、裁决所根据的证据是伪造的、对方当事人隐瞒了足以影响公正裁决的证据或仲裁员在仲裁该案时有索贿受贿、徇私舞弊、枉法裁决行为等情形之一的，可以自收到仲裁裁决书之日起三十日内向劳动争议仲裁委员会所在地的中级人民法院申请撤销裁决。
- 如果您认为赔偿基数的计算错误属于上述情形之一，可以向法院申请撤销仲裁裁决。
向法院起诉：
- 如果仲裁裁决不是终局裁决，或者您未在规定期限内申请撤销仲裁裁决，您还可以向法院提起诉讼，要求重新计算赔偿基数。
- 在诉讼过程中，您需要提供充分的证据证明仲裁裁决在赔偿基数计算上存在错误，并请求法院依法判决。
三、建议与注意事项
收集证据：
- 在申请撤销仲裁裁决或向法院起诉前，务必收集充分的证据来证明您的主张。这包括但不限于劳动合同、工资条、银行流水记录、社保缴纳记录等。
咨询专业律师：
- 劳动仲裁和诉讼涉及复杂的法律程序和实体问题，建议您在采取行动前咨询专业律师的意见。律师可以根据您的具体情况提供针对性的法律建议和帮助。
注意时效：
- 无论是申请撤销仲裁裁决还是向法院起诉，都需要注意时效问题。逾期申请或起诉可能会丧失救济机会。
如果您在劳动仲裁赔偿基数计算方面存在疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。我将根据您的具体情况提供专业的法律意见和帮助。