在少发工资的情况下申请劳动仲裁，赔偿金和补偿金的确定需根据具体情形来分析，核心结论如下：
- 补偿金（经济补偿）的确定
经济补偿通常适用于用人单位存在过错，导致劳动合同解除或终止的情形。在少发工资的情况下，若劳动者因此提出解除劳动合同，用人单位需支付经济补偿。具体标准为：
- 计算基数：以劳动者在劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资为基数（含基本工资、奖金、津贴等货币性收入）。
- 计算年限：每满一年支付一个月工资；六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，支付半个月工资。
- 例外情形：若用人单位因“未及时足额支付劳动报酬”被劳动者解除合同，经济补偿的计算方式与上述一致，但需注意，若用人单位存在恶意拖欠（如经劳动监察部门责令改正仍不支付），可能涉及赔偿金问题。
- 赔偿金的确定
赔偿金适用于用人单位存在违法行为，且需承担惩罚性责任的情形。在少发工资的语境下，赔偿金可能涉及以下两种情况：
- 加付赔偿金：根据《劳动合同法》第八十五条，若用人单位未及时足额支付劳动报酬，经劳动行政部门责令限期支付后仍不支付的，需按应付金额的50%-100%向劳动者加付赔偿金。
- 操作要点：劳动者需先向劳动监察部门投诉，由劳动行政部门出具《限期整改指令书》等文书，若用人单位逾期未支付，方可主张加付赔偿金。
- 违法解除劳动合同的赔偿金：若用人单位因少发工资而违法解除劳动合同（如以“旷工”“严重违纪”等理由单方解除，但无事实依据），劳动者可主张赔偿金，标准为经济补偿的二倍（即“2N”）。
- 关键证据：劳动者需证明用人单位解除行为违法（如解除通知、规章制度、工资发放记录等）。
- 实务建议
- 证据收集：保留工资条、银行流水、劳动合同、解除通知等材料，证明用人单位存在少发工资的事实及具体金额。
- 程序选择：若仅主张经济补偿，可直接申请劳动仲裁；若主张加付赔偿金，需先向劳动监察部门投诉。
- 金额计算：注意区分“应发工资”与“实发工资”，补偿金/赔偿金的计算基数通常以“应发工资”为准（扣除社保、个税前的金额）。
总结：少发工资引发的劳动仲裁中，经济补偿与赔偿金的确定需结合具体情形（如是否解除合同、用人单位是否存在恶意、是否经劳动行政部门处理等）。建议根据实际情况选择维权路径，并提前准备充分证据。如有进一步疑问，可直接向我咨询。