公司未申报特殊工种是违法的。以下从几个方面为你详细分析：

一、法律背景与规定

特殊工种通常指的是那些因工作性质、工作环境或工作条件等因素，对劳动者身体健康有较大影响的工种。根据相关法律法规，公司有义务对从事特殊工种的员工进行申报，并确保这些员工得到相应的劳动保护和待遇。这是为了保障劳动者的合法权益，防止因工作原因导致的健康损害。

二、未申报特殊工种的法律后果

1. 行政处罚：如果公司未按照规定申报特殊工种，可能会面临劳动行政部门的处罚，包括但不限于罚款、责令改正等。这些处罚旨在促使公司遵守法律法规，保障劳动者的权益。

2. 劳动纠纷风险：未申报特殊工种还可能导致公司与员工之间的劳动纠纷。员工可能会因此认为公司未履行其法定义务，从而要求公司承担相应的法律责任，如支付加班费、提供劳动保护等。在极端情况下，员工甚至可能选择解除劳动合同并要求公司支付经济补偿。

3. 影响员工权益：特殊工种员工通常享有更高的劳动保护标准和福利待遇。如果公司未申报特殊工种，这些员工可能无法享受到应有的权益，如定期的健康检查、特殊的劳动保护用品等。这不仅可能损害员工的身体健康，还可能影响其工作积极性和效率。

三、建议与措施

1. 及时申报：公司应尽快对从事特殊工种的员工进行申报，并确保申报信息的准确性和完整性。这有助于公司遵守法律法规，避免不必要的法律风险和劳动纠纷。

2. 加强内部管理：公司应建立健全的内部管理制度，明确特殊工种的认定标准和申报流程。同时，加强对员工的培训和宣传，提高员工对特殊工种的认识和重视程度。

3. 关注员工权益：公司应关注特殊工种员工的权益保障情况，确保他们享受到应有的劳动保护和福利待遇。这有助于增强员工的归属感和忠诚度，提高公司的整体竞争力。

如果你或你所在的公司涉及特殊工种申报问题，或者有任何关于劳动工伤方面的疑问，都可以直接向我咨询。我会根据你的具体情况，为你提供专业的法律建议和帮助。