员工离职后公司发通知扣除绩效，员工可通过以下渠道申诉：

1. 与公司内部协商解决
   首先建议员工与公司人力资源部门或直接上级进行沟通，明确了解公司扣除绩效的具体依据（如劳动合同、公司规章制度、绩效考核标准等）。若公司无法提供合法合理的依据，员工可要求公司撤销扣除决定。
   法律依据：根据《劳动合同法》第三十条，用人单位应及时足额支付劳动报酬，不得克扣或无故拖欠。若公司扣除绩效无合法依据，员工有权要求补发。

2. 向劳动监察部门投诉
   若内部协商无果，员工可向当地劳动保障监察大队投诉（可通过12333热线或当地人社局官网查询联系方式）。劳动监察部门有权对公司违法行为进行调查，并责令限期支付拖欠的工资。
   注意：投诉时需提供劳动合同、工资条、绩效考核记录、公司扣除通知等证据材料。

3. 申请劳动仲裁
   若投诉后仍未解决，员工可向劳动合同履行地或公司所在地的劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求公司支付被扣除的绩效工资及可能的赔偿金。
   关键点：

   • 仲裁时效为离职后1年内；
     
   • 需准备书面仲裁申请书及证据材料（如前所述）；
     
   • 仲裁裁决具有法律效力，若公司不履行，员工可申请法院强制执行。

4. 通过法律诉讼维权
   若对仲裁结果不服，员工可在收到裁决书后15日内向法院提起诉讼。此途径成本较高，建议优先通过前三种方式解决。

补充建议：

• 员工在离职前应尽量保留与绩效相关的证据（如考核表、沟通记录等），避免公司事后单方面修改标准；
  
• 若公司扣除绩效涉及恶意克扣（如以“罚款”名义随意扣减），可能违反《工资支付暂行规定》第十六条，员工可同时主张加付赔偿金（需经劳动行政部门责令限期支付后仍未支付）。
  

如有进一步疑问或需协助准备申诉材料，可直接向我咨询。