周日加班工资的计算需分情况讨论，具体如下：

1. 劳动合同约定26天工作制是否合法
   根据《劳动法》第三十六条，劳动者每日工作时间不超过8小时、平均每周不超过44小时。若劳动合同约定每月26天工作制（即每周工作约5.7天），需满足以下条件才合法：

   • 每日工作时间不超过8小时，且每月总工时不超过176小时（22天×8小时）；
     
   • 若超出176小时，超出部分需按加班计算工资。
     若26天工作制导致月总工时超过176小时，超出部分属于加班，用人单位需支付加班费。

2. 周日加班工资的计算标准
   根据《劳动法》第四十四条，休息日（如周日）安排劳动者工作且不能补休的，需支付不低于工资200%的工资报酬。具体计算需分两步：

   • 确定日工资基数：
     日工资 = 月工资 ÷ 21.75天（法定月计薪天数，与合同约定26天无关）。
     
     • 若按原合同工资5000元计算：日工资 = 5000 ÷ 21.75 ≈ 229.89元；
       
     • 若按涨薪后8000元计算：日工资 = 8000 ÷ 21.75 ≈ 367.82元。
       
   • 计算周日加班工资：
     周日加班工资 = 日工资 × 200%。
     
     • 若按5000元基数：229.89 × 2 = 459.78元/天；
       
     • 若按8000元基数：367.82 × 2 = 735.64元/天。
       关键点：加班工资基数以实际发放的月工资为准（如涨薪后按8000元计算），但需扣除非常规性奖金、补贴等。

3. 合同约定与实际履行冲突时的处理

   • 若劳动合同明确约定26天工作制且工资包含加班费（如5000元已包含周日加班工资），需审查约定是否合法：
     
     • 若月总工时未超176小时，约定有效；
       
     • 若超176小时，超出部分仍需按200%补足差额。
       
   • 若涨薪后未重新约定加班费基数，用人单位不得单方面降低计算标准，应以涨薪后的8000元为基数。

建议行动：

1. 核对每月实际工作时长，确认是否超出176小时；
   
2. 要求用人单位提供工资条，明确工资构成中是否已包含加班费；
   
3. 若用人单位拒绝支付足额加班费，可向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
   

提示：法律对加班工资的计算有严格规定，用人单位不得通过合同约定规避法定义务。如有疑问，可直接向我咨询具体计算细节或维权流程。