取消组长职务是否合法，需根据具体情况来判断，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：
一、从公司规章制度的角度
如果公司有明确的规章制度，规定了组长的职责、任免条件及程序，且取消组长职务的行为符合这些规定，那么该行为通常是合法的。例如，若规章制度中明确规定，组长在连续两个季度未完成业绩目标时，公司有权取消其组长职务，那么当这一条件满足时，公司取消组长职务就是合法的。
二、从劳动合同的角度
劳动合同约定：如果劳动合同中明确约定了组长的职位、职责以及任免条件，且取消组长职务的行为符合劳动合同的约定，那么该行为也是合法的。但需要注意的是，劳动合同中的约定不能违反法律法规的强制性规定。
变更劳动合同：如果取消组长职务涉及到劳动合同内容的变更，如薪资、职位等，那么公司需要与员工进行协商，并达成一致意见。未经员工同意，公司单方面变更劳动合同内容（包括取消组长职务）可能构成违法。
三、从法律法规的角度
平等就业权：公司在取消组长职务时，不能因员工的性别、年龄、种族、宗教信仰等非法因素而进行歧视。如果取消组长职务的行为存在歧视性，那么该行为就是违法的。
程序合法性：公司在取消组长职务时，需要遵循一定的程序，如提前通知、听取员工意见、进行解释说明等。如果公司未遵循这些程序，直接取消组长职务，可能构成违法解除或变更劳动合同。
四、实际操作建议
审查公司规章制度：公司应首先审查自己的规章制度，确保取消组长职务的行为符合规章制度的规定。
与员工协商：如果取消组长职务涉及到劳动合同内容的变更，公司应与员工进行协商，并达成一致意见。
遵循法定程序：公司在取消组长职务时，应遵循法定程序，如提前通知、听取员工意见等，以确保行为的合法性。
保留证据：公司应保留与取消组长职务相关的所有证据，如规章制度、劳动合同、通知记录、员工意见等，以备不时之需。
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