结论：代班的私自付款给工人是否违法，需根据具体情况判断，可能涉及无权代理、职务侵占或挪用资金等法律问题。以下从不同角度进行分析，并提供相应的处理建议。
一、代班人员行为性质分析
无权代理：
- 若代班人员未经公司明确授权，私自以公司名义付款给工人，可能构成无权代理。根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，无权代理行为未经被代理人追认的，对被代理人不发生效力，由行为人承担责任。
- 处理建议：公司应尽快查明事实，若确认代班人员无权代理，且公司未追认该行为，公司有权要求代班人员返还已支付的款项，并可能追究其法律责任。
职务侵占或挪用资金：
- 若代班人员利用职务之便，将公司资金私自支付给工人，可能构成职务侵占或挪用资金。这取决于代班人员的具体行为、资金来源及用途等因素。
- 处理建议：公司应立即报警，并配合警方调查。若构成犯罪，代班人员将面临刑事处罚。同时，公司应加强内部管理，防止类似事件再次发生。
二、工人角度分析
善意取得：
- 若工人不知代班人员无权代理，且支付行为符合交易习惯，工人可能构成善意取得。但这一判断需结合具体证据和法律规定进行。
- 处理建议：工人应保留好相关证据，如付款凭证、代班人员的身份证明等。若公司主张代班人员无权代理，工人可依据善意取得原则进行抗辩。
不当得利：
- 若工人明知代班人员无权代理，或支付行为存在明显不合理之处，工人可能构成不当得利。根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，不当得利人应返还取得的利益。
- 处理建议：公司有权要求工人返还已支付的款项。若工人拒绝返还，公司可通过法律途径追讨。
三、公司角度处理建议
立即调查：
- 公司应尽快查明代班人员私自付款的事实，包括付款金额、时间、方式及工人信息等。
评估损失：
- 公司应评估因代班人员行为造成的损失，包括直接经济损失和间接经济损失（如声誉损失等）。
采取措施：
- 根据调查结果和损失评估，公司可采取以下措施：
- 要求代班人员返还已支付的款项；
- 追究代班人员的法律责任（如民事赔偿、刑事处罚等）；
- 加强内部管理，完善授权和审批流程，防止类似事件再次发生。
法律途径：
- 若代班人员拒绝返还款项或公司认为其行为构成犯罪，公司可通过法律途径追讨损失或追究刑事责任。
后续思考：在处理此类事件时，公司应注重证据的收集和保存，以便在后续的法律程序中维护自身权益。同时，公司应加强内部管理，提高员工的法律意识和风险意识，防止类似事件再次发生。若您在此过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。