加班工资公司不可以完全自己约定，但可以在法律规定的范围内进行一定的协商和安排。以下从不同角度为你详细分析：

法律规定层面

根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，加班工资的计算和支付有明确的法律标准，公司不能随意设定。具体来说：

1. 工作日加班：用人单位安排劳动者延长工作时间的，支付不低于工资的百分之一百五十的工资报酬。
2. 休息日加班：用人单位安排劳动者在休息日工作又不能安排补休的，支付不低于工资的百分之二百的工资报酬。
3. 法定节假日加班：用人单位安排劳动者在法定休假日工作的，支付不低于工资的百分之三百的工资报酬。

这些规定是强制性的，公司必须遵守，不能通过内部规定或合同来规避或降低加班工资的支付标准。

公司自主约定层面

虽然加班工资的计算和支付有明确的法律标准，但公司在法律允许的范围内，可以与劳动者就加班的具体安排、加班工资的支付方式等进行一定的协商和约定。例如：

1. 加班审批制度：公司可以建立加班审批制度，要求劳动者在加班前提交加班申请，经公司批准后方可加班。这有助于公司合理安排工作，避免不必要的加班。
2. 加班工资支付方式：公司可以与劳动者约定加班工资的支付方式，如按月支付、按季度支付等。但无论采用何种支付方式，都必须确保加班工资的支付不低于法律规定的标准。
3. 调休安排：对于休息日加班的情况，公司可以与劳动者协商安排调休，以替代支付加班工资。但调休必须在合理的时间内安排，且不能影响劳动者的正常休息和休假权益。

注意事项

1. 合法合规：公司在与劳动者约定加班相关事宜时，必须确保约定内容合法合规，不得违反法律法规的强制性规定。
2. 明确告知：公司应将加班政策、加班工资的计算和支付标准等明确告知劳动者，确保劳动者在知情的情况下自愿加班。
3. 保留证据：公司应妥善保留与加班相关的证据，如加班申请、加班记录、加班工资支付凭证等，以备在发生劳动争议时作为证据使用。

总结与建议：加班工资的计算和支付有明确的法律标准，公司不能完全自己约定。但公司可以在法律允许的范围内与劳动者就加班的具体安排、加班工资的支付方式等进行协商和约定。建议公司在制定加班政策时，充分考虑法律法规的要求和劳动者的权益，确保加班政策的合法性和合理性。如果你在加班工资方面遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。