结论：员工入职两天离职且未来得及签合同，对于公司而言，确实存在一定的法律风险，但风险相对较小，且主要取决于后续的处理方式。以下是从不同角度的详细分析：
一、法律风险分析
未签订书面劳动合同的法律后果：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第十条的规定，建立劳动关系，应当订立书面劳动合同。已建立劳动关系，未同时订立书面劳动合同的，应当自用工之日起一个月内订立书面劳动合同。
- 若员工入职两天即离职，且未签订书面劳动合同，从法律条文上看，公司并未直接违反“一个月内订立书面劳动合同”的规定。但若此后公司未能在一个月内与新入职员工补签合同，则可能面临支付双倍工资等法律风险。
事实劳动关系的认定：
- 即使未签订书面劳动合同，只要员工实际为公司提供了劳动，且公司接受了这种劳动，双方之间就形成了事实劳动关系。
- 在此情况下，员工仍有权要求公司支付其工作期间的工资，并可能享有其他劳动权益，如社会保险等。
二、风险应对建议
及时补签劳动合同：
- 尽管员工已离职，但公司仍应尽快与其补签劳动合同，以明确双方的权利和义务，避免未来可能出现的纠纷。
- 若员工拒绝补签，公司应保留好相关证据，如工作记录、工资支付凭证等，以证明双方之间存在事实劳动关系。
支付应得工资：
- 公司应确保支付员工工作期间的应得工资，避免因拖欠工资而引发的法律纠纷。
完善入职流程：
- 公司应完善入职流程，确保在员工入职时即与其签订书面劳动合同，并明确双方的权利和义务。
- 同时，公司还可以考虑在劳动合同中约定试用期、离职通知期等条款，以进一步降低法律风险。
三、特殊情况考虑
- 若员工在离职时提出异议：如员工认为公司未与其签订书面劳动合同侵犯了其权益，并可能提出劳动仲裁或诉讼，公司应积极应对，提供相关证据证明双方之间已形成了事实劳动关系，并已支付了应得工资。
- 若公司存在过错：如公司因管理疏忽或故意拖延导致未能在一个月内与员工签订书面劳动合同，且员工因此遭受了损失，公司可能需要承担相应的赔偿责任。
总结与建议：员工入职两天离职且未来得及签合同，虽然公司面临的法律风险相对较小，但仍需谨慎处理。公司应及时补签劳动合同（若可能）、支付应得工资，并完善入职流程以降低未来可能出现的法律风险。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。