结论：在“保底加计件”的工资模式下，员工自离时，工资的计算不应仅限于计件工资部分，保底工资部分同样应予以考虑。具体计算方式需依据劳动合同的约定以及相关法律法规的规定。

分析说明：

1. 保底工资的性质与目的：

   • 保底工资是用人单位与劳动者在劳动合同中约定的，确保劳动者在特定工作条件下（如工作量不足、生产淡季等）能够获得的基本生活保障。
   • 其目的在于保障劳动者的基本生活需求，避免因工作量波动而导致的收入不稳定。

2. 计件工资的性质与计算：

   • 计件工资是根据劳动者完成的合格产品数量或作业量，按照预先设定的计件单价来计算的工资形式。
   • 它体现了多劳多得的原则，是劳动者劳动成果的直接经济回报。

3. “保底加计件”工资模式的解读：

   • 在这种模式下，劳动者的工资由保底工资和计件工资两部分组成。
   • 保底工资是固定的，而计件工资则根据实际工作量浮动。
   • 当劳动者的工作量超过一定标准时，其总收入将高于保底工资；当工作量不足时，其总收入至少应等于保底工资。

4. 自离时的工资计算：

   • 自离，即劳动者未经用人单位同意，擅自离职的行为。
   • 在自离的情况下，劳动者仍有权获得其已提供劳动所对应的工资报酬。
   • 这包括保底工资部分和计件工资部分。用人单位不能仅因劳动者自离而拒绝支付保底工资。

5. 相关法律法规的依据：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，劳动者有权获得与其劳动相应的报酬。
   • 用人单位不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。
   • 在“保底加计件”的工资模式下，保底工资和计件工资都是劳动者劳动报酬的组成部分，均应受到法律保护。

法律建议：

• 对于劳动者而言，在签订劳动合同时，应明确约定工资的计算方式和支付标准，特别是保底工资和计件工资的具体数额和计算方法。
• 在自离的情况下，劳动者应保留好相关证据（如工作记录、计件单据等），以便在必要时维护自己的合法权益。
• 对于用人单位而言，应严格遵守相关法律法规的规定，按时足额支付劳动者的工资报酬，避免因工资问题而引发的劳动纠纷。

可能后果：

• 如果用人单位仅支付计件工资而拒绝支付保底工资，劳动者有权向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁，要求用人单位支付拖欠的工资报酬及可能的经济补偿。
• 用人单位可能因此面临法律制裁和声誉损失，影响企业的正常运营和发展。

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