缺勤是否扣全勤奖，需视具体情况及公司规章制度而定。以下从不同角度进行分析：
公司规章制度：
- 全勤奖的设立与扣除通常由公司规章制度明确规定。若公司规章制度中明确规定了缺勤（包括事假、病假、旷工等）将扣除全勤奖，则员工缺勤时，公司有权依据规定扣除全勤奖。
- 反之，若公司规章制度中未明确规定缺勤将扣除全勤奖，或者规定缺勤达到一定天数或比例后才扣除全勤奖，则员工缺勤时，公司不应随意扣除全勤奖。
缺勤类型：
- 事假：员工因个人原因申请的事假，若公司规章制度中规定事假将扣除全勤奖，则员工事假期间，公司有权扣除全勤奖。
- 病假：员工因病申请的病假，若公司规章制度中规定病假将扣除全勤奖，且员工未提供有效的医疗证明或未按照公司规定流程申请病假，则公司可能扣除全勤奖。但若员工提供了有效的医疗证明，且按照公司规定流程申请了病假，则公司通常不应扣除全勤奖（具体还需看公司规章制度）。
- 旷工：员工未经批准擅自缺勤的，属于旷工行为。若公司规章制度中规定旷工将扣除全勤奖，则员工旷工时，公司有权扣除全勤奖，且可能进一步追究员工的违纪责任。
法律视角：
- 从法律角度来看，全勤奖属于公司给予员工的福利或奖励，并非法定工资组成部分。因此，公司有权根据自身规章制度决定全勤奖的发放与扣除。
- 但公司在制定和执行规章制度时，应确保规章制度的合法性、合理性和透明度，避免侵犯员工的合法权益。例如，规章制度应经过民主程序制定，并向员工公示或告知；扣除全勤奖的规定应明确、具体，且不得违反法律法规的强制性规定。
建议：
- 对于员工而言，应仔细阅读并了解公司规章制度中关于全勤奖的规定，遵守公司规定，避免缺勤或旷工行为。若因特殊原因需要缺勤，应提前向公司申请并说明情况，尽量减少对全勤奖的影响。
- 对于公司而言，应制定合法、合理、透明的规章制度，明确全勤奖的发放与扣除条件，并向员工公示或告知。在执行规章制度时，应确保公平、公正、公开，避免侵犯员工的合法权益。
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